结论：劳动合同中约定最低工资作为周日加班的工资是不合法的，劳动者有权要求用人单位按照法律规定支付加班费，并可通过合法途径维护自身权益。

一、法律依据与规定

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，用人单位应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这里的“工资”指的是劳动者在正常工作时间内所获得的报酬，而非最低工资标准。因此，将最低工资作为周日加班的工资，显然违反了这一法律规定。

二、加班费计算基数的确定

1. 劳动合同明确约定工资数额：应以劳动合同约定的工资作为加班费的计算基数。若工资项目分为“基本工资”、“岗位工资”、“职务工资”等，则应以各项工资的总和作为基数计发加班费。

2. 劳动合同未明确约定或约定不明确：应以实际工资作为加班费的计算基数，这包括用人单位直接支付给职工的工资、奖金、津贴、补贴等（不含加班费、伙食补助和劳动保护补贴）。

三、最低工资标准与加班费的关系

最低工资标准是劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。而加班费是劳动者在正常工作时间之外额外付出劳动所应获得的额外报酬。因此，加班费的计算基数应当是劳动者正常工作时间的工资，而非最低工资。将最低工资作为加班费的计算基数，实际上是变相降低了劳动者的加班工资待遇，剥夺了劳动者依法应得的额外报酬。

四、劳动合同条款的效力与法律责任

由于劳动合同中约定最低工资作为周日加班工资的条款违反了《劳动法》关于加班费计算基数的规定，因此这些条款是无效的。如果用人单位不按照法律规定支付加班费，劳动者可以向劳动行政部门投诉举报，由劳动行政部门依法进行调查处理，并责令用人单位限期支付加班费；逾期不支付的，还将责令用人单位按应付金额的一定比例向劳动者加付赔偿金。此外，劳动者还可以通过申请劳动仲裁、提起诉讼等方式来维护自身合法权益。

五、劳动者的维权途径

1. 向劳动行政部门投诉举报：劳动行政部门将依法调查处理，并要求用人单位限期支付加班费及可能的赔偿金。

2. 申请劳动仲裁：如无法通过协商解决，劳动者可向当地劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。

3. 提起诉讼：如对仲裁结果不满，劳动者可依法向人民法院提起诉讼，以维护自身合法权益。

建议：作为劳动者，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资和加班费的约定。如果发现合同中有违法或不合理的内容，应及时与用人单位协商修改。如果用人单位拒绝修改或已经违反了相关法律规定，劳动者应积极维护自身权益，通过合法途径寻求帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。