若公司超过6个月未经营且已被通知，核心处理方向是及时响应通知要求，避免被吊销营业执照，同时根据实际情况决定是否继续经营或办理注销手续。以下是具体分析：

1. 立即响应通知要求
   收到市场监管部门的通知后，务必在规定期限内（通常为15-30日）提交书面说明或整改方案。若未及时响应，可能被直接认定为“长期停业未经营”，面临吊销营业执照的风险。整改方案需明确公司未来经营计划（如恢复经营的时间表、业务方向调整等），或说明停业原因（如疫情、资金链断裂等客观因素）。

2. 评估公司实际经营状态

   • 若计划继续经营：需在整改期内恢复经营活动，例如重新租赁办公场所、招聘员工、开展业务等，并保留相关证据（如合同、发票、考勤记录等）以证明公司实际运营。
     
   • 若无意继续经营：应主动办理注销登记，避免因“长期停业”被吊销营业执照后，法定代表人被列入“严重违法失信企业名单”（黑名单），影响个人信用（如贷款、任职等）。注销流程包括清算组备案、债权人公告、税务注销、工商注销等环节，需依法完成。

3. 防范法律风险

   • 吊销营业执照的后果：公司被吊销后，仍需在15日内成立清算组进行清算，否则股东可能被追责；若未清算即注销，股东可能需对公司债务承担连带责任。
     
   • 税务风险：长期停业可能导致税务异常（如未申报、欠税），需在整改期内补办税务登记、补缴税款及滞纳金，否则可能被税务机关强制执行或列入“非正常户”。

4. 特殊情形处理

   • 因不可抗力停业：如因自然灾害、政策调整等客观原因停业，可向市场监管部门提交证明材料（如政府文件、灾害公告等），申请延长整改期限或免于处罚。
     
   • 被误判停业：若公司实际在经营但未及时公示年报或变更地址，需补充提交经营证据（如银行流水、业务合同等），并完成年报公示或地址变更登记。

行动建议：

• 立即整理公司近6个月的经营证据（如合同、发票、银行流水等），评估是否符合“实际经营”标准；
  
• 若决定注销，优先处理税务清算（避免税务罚款），再办理工商注销；
  
• 若需继续经营，制定详细的恢复计划并留存书面记录，以备监管部门核查。
  

如有具体操作疑问或需协助准备材料，可直接向我咨询，我会结合您所在地区的政策细节进一步解答。