针对您提出的“违法建筑发生买卖关系后如何处理”的问题，这是一个涉及法律效力和责任承担的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

一、合同效力的认定

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国民法典》以及《城乡规划法》的相关规定，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的建筑物，被认定为违法建筑。因此，涉及违法建筑的买卖合同，在法律上通常会被视为无效合同。这一认定是处理此类合同纠纷的基础。

二、无效合同的处理方式

1. 返还财产：

   • 一旦合同被认定为无效，根据《民法典》的相关规定，双方应当返还因合同取得的财产。这意味着，如果买方已经支付了购房款，卖方需要退还这笔款项；同时，如果买方已经占有了违法建筑，也应当将其返还给卖方。

2. 折价补偿：

   • 在某些情况下，违法建筑可能已经被拆除或者无法返还给卖方。这时，买方有权要求卖方按照建筑的现有价值进行折价补偿。补偿的金额通常需要通过专业的评估机构来确定。

3. 赔偿损失：

   • 如果因为合同的无效导致了一方或者双方的损失，过错方需要承担赔偿责任。在违法建筑买卖合同中，如果卖方明知是违法建筑仍然出售，那么卖方应当承担主要责任，包括购房款的利息、买方的装修费用等。如果买方也知情，那么双方需要根据各自的过错比例来分担损失。

三、合同不同阶段的处理建议

1. 合同未履行阶段：

   • 如果合同尚未履行或者只履行了一部分，我建议双方尽快协商解除合同。这样可以避免进一步的法律风险和经济损失。

2. 合同部分或全部履行阶段：

   • 如果合同已经部分或者全部履行，那么需要综合考虑买方的权益保护、卖方的责任以及违法建筑的性质。如果买方能够证明在购买时并不知情，且卖方存在隐瞒或者欺诈行为，那么买方有权要求退款以及赔偿。

四、寻求专业法律帮助的重要性

由于违法建筑买卖合同的复杂性，我强烈建议双方在处理此类问题时寻求专业律师的帮助。律师能够提供针对性的法律建议和解决方案，帮助双方维护自己的合法权益，降低风险。

五、违法建筑的后续处置

最后，需要提醒的是，违法建筑的存在违反了规划和建设法规。相关部门可能会采取拆除、没收等措施来处理这些建筑。因此，买卖双方应当配合相关部门的工作，并承担相应的后果。

综上所述，处理违法建筑买卖合同时，应首先确认合同无效，然后根据合同的履行情况采取相应的处理方式，包括返还财产、折价补偿和赔偿损失。同时，双方应当充分考虑法律风险和责任分担，并在必要时寻求专业律师的帮助以确保自己的合法权益得到妥善维护。在任何情况下，遵守法律法规都是处理此类问题的基本原则。