结论概述：公司更名后，若合同主体仍显示为原公司名但加盖了新公章，该合同的效力需结合具体情况判断。一般情况下，若更名手续合法且新公章真实有效，合同仍然有效。以下从不同角度进行详细分析：

一、公司更名与合同主体的关系

1. 公司更名的法律性质：

   • 公司更名属于公司登记事项的变更，根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，公司名称变更需办理工商变更登记手续。
   • 更名后，公司的法律主体资格并未改变，只是名称发生了变化。因此，原公司签订的合同，在公司更名后，其权利义务应由更名后的公司继续承担。

2. 合同主体的认定：

   • 合同主体是指签订合同的各方当事人。在公司更名的情况下，虽然公司名称发生了变化，但合同主体并未改变，因为公司的法律主体资格（如统一社会信用代码）并未发生变化。
   • 因此，即使合同上显示的是原公司名，但只要能够证明该合同是由更名后的公司实际签订或承继的，合同仍然有效。

二、新公章的法律效力

1. 公章的代表意义：

   • 公章是公司对外表示意思表示的重要工具，具有法律效力。加盖公章的行为通常被视为公司的真实意思表示。
   • 在公司更名后，新公章代表了更名后的公司的意志。因此，加盖新公章的行为应被视为更名后公司的行为。

2. 新公章在合同上的使用：

   • 如果合同上加盖了新公章，即使合同主体仍显示为原公司名，但结合公司更名的事实和新公章的法律效力，可以认为该合同是更名后的公司实际签订或承继的。
   • 当然，为了确保合同的明确性和避免纠纷，最好在合同中明确注明公司更名的情况，并加盖新公章以确认。

三、实际操作建议与风险防范

1. 完善更名手续：

   • 确保公司更名手续合法、完整，包括办理工商变更登记、刻制新公章等。
   • 保留好更名相关的所有文件和资料，以备不时之需。

2. 合同更新与确认：

   • 在公司更名后，及时与合同相对方沟通，确认合同的继续履行或变更事宜。
   • 如果可能的话，可以签订补充协议或重新签订合同，明确公司更名的情况和合同主体的变更。

3. 风险防范措施：

   • 在合同中明确约定公司更名时的处理方式，如“若公司名称发生变更，本合同的权利义务由变更后的公司继续承担”。
   • 在加盖新公章前，确保新公章已经合法备案并具有法律效力。
   • 定期对合同进行审查和更新，确保合同的准确性和有效性。

四、可能遇到的法律后果

1. 合同有效：

   • 如果公司更名手续合法且新公章真实有效，且合同相对方对此无异议或已经通过实际行为表示接受，则合同仍然有效。

2. 合同纠纷：

   • 如果合同相对方对公司更名或新公章的使用提出异议，可能导致合同纠纷。此时，需要依据相关法律法规和合同约定进行解决。
   • 在纠纷解决过程中，公司需要提供充分的证据证明更名手续的合法性和新公章的法律效力。

总结与建议：公司更名后，若合同主体仍显示为原公司名但加盖了新公章，该合同的效力需结合具体情况判断。为了确保合同的明确性和避免纠纷，建议公司在更名后及时与合同相对方沟通并更新合同内容。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。