在工程合同中，如果未明确签订逾期违约金的相关条款，那么赔偿的确定将是一个相对复杂但至关重要的问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、首要原则：合同约定优先
首先，我们要明确的是，如果合同中有对逾期违约金的明确约定，那么应严格按照合同约定来执行。这包括违约金的计算方式、支付时间等具体条款。然而，在您所描述的情况下，合同并未对此进行约定，因此我们需要考虑其他因素。
二、无约定时的处理方式
实际损失计算：
- 在没有合同约定的情况下，赔偿金额应基于实际损失来确定。这包括直接损失和间接损失。
- 直接损失如因工程逾期导致的额外工人工资、材料保管费用、设备租赁费用等，这些应有明确的支付凭证和记录。
- 间接损失如因工程延误导致的预期利润损失、租金损失等，这些虽然难以量化，但应通过合理的预测和估算来确定，并提供相应的证据支持。
行业惯例与标准：
- 在某些地区或特定类型的工程项目中，可能存在一些通用的工期延误赔偿标准或惯例。这些可以作为重要的参考依据，但并不能直接作为计算赔偿金的依据。
- 如果双方在以往类似项目中有过关于工期延误赔偿的处理方式，且形成了一定的默契和惯例，那么在本次合同没有约定的情况下，也可以参照执行。
法定标准参考：
- 在没有明确约定和行业标准可参照的情况下，可以参照中国人民银行发布的同期同类贷款利率、全国银行间同业拆借中心公布的贷款市场报价利率（LPR）等标准，作为确定损失赔偿数额的参考。
三、赔偿原则与建议
赔偿原则：
- 在确定赔偿金额时，应遵循公平、合理、可预见的原则。赔偿金额应能够真实反映受损害方的实际损失，并且不得超过违约一方在签订合同时能够预见到的损失范围。
建议措施：
- 为避免因合同未约定逾期违约金而产生的纠纷，建议在签订工程合同时明确约定违约金的计算方法或赔偿标准。
- 双方应密切关注工程进度和潜在风险，及时采取措施避免工期延误。一旦发生延误，双方应积极协商解决纠纷，并尽量通过友好协商达成赔偿协议。
四、法律途径
如果双方无法就赔偿金额达成一致，可以通过仲裁或诉讼等法律途径来解决问题。专业的仲裁机构或法院将根据具体证据和实际情况进行裁决，确保双方的合法权益得到保障。
总结
综上所述，当工程合同中未签订逾期违约金时，赔偿的确定应综合考虑实际损失、行业惯例与标准以及法律规定。双方应秉持公平、合理的原则进行协商和解决纠纷，以维护自身的合法权益。同时，建议在未来的合同签订中明确约定逾期违约金的计算方法和赔偿标准，以减少后续纠纷的发生。