合同经复审单位审核结束后，通常需要根据审核意见进行相应处理，具体处理方式取决于审核意见的性质和内容。以下从不同角度为你详细分析：

1. 审核意见为通过或无实质性修改建议

   • 若复审单位明确表示合同通过审核，或提出的修改建议仅为非实质性条款（如格式调整、错别字修正等），通常可直接推进合同签署流程。
   • 建议：保存审核意见作为附件，与合同正本一并归档，确保流程完整性。

2. 审核意见为有条件通过或需修改

   • 若复审单位提出实质性修改建议（如权利义务调整、违约责任变更等），需根据意见修改合同条款，并重新提交审核或与对方协商。
   • 操作步骤：
     1. 逐条分析审核意见，明确修改内容及法律依据；
     2. 与合同相对方沟通修改方案，争取达成一致；
     3. 修改后再次提交复审单位确认，或按内部流程完成终审。
   • 注意：若修改涉及核心条款（如价款、履行期限等），建议通过补充协议或书面确认函固定变更内容，避免口头约定。

3. 审核意见为不通过或终止审核

   • 若复审单位认为合同存在重大法律风险（如违反强制性规定、主体不适格等），可能直接否决合同或要求终止审核。
   • 应对措施：
     1. 立即暂停合同签署流程，避免无效合同风险；
     2. 与复审单位深入沟通，了解否决的具体原因及法律依据；
     3. 根据沟通结果，选择重新起草合同、补充材料或放弃合作。
   • 风险提示：若强行签署被否决的合同，可能面临合同无效、行政处罚甚至刑事责任。

4. 审核意见涉及多方协调

   • 若合同涉及多方主体（如联营合同、框架协议等），复审单位可能要求协调各方意见后再定稿。
   • 建议：
     1. 组织各方召开协调会，明确争议焦点及解决方案；
     2. 制定修改时间表，避免因拖延影响合同效力；
     3. 最终版本需经所有主体书面确认，确保无遗漏。

总结：合同审核结束后的处理需以审核意见为依据，结合合同性质、交易目的及法律风险综合判断。若对审核意见或处理方式有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体条款和案例为你提供专业建议。