申请法院调查公司在银行贷款资料的法律依据主要包含以下方面：

1. 《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定
   根据《民事诉讼法》第六十四条第二款，当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。在涉及公司银行贷款资料的案件中，若该资料属于当事人因客观原因（如银行拒绝提供、资料涉及商业秘密等）无法自行获取，且对案件事实认定具有关键作用，当事人可依法申请法院调查取证。

2. 《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》的细化
   该规定第二十条明确，当事人及其诉讼代理人申请人民法院调查收集证据，应当在举证期限届满前提交书面申请。申请书应当载明被调查人的姓名或者单位名称、住所地等基本情况、所要调查收集的证据的内容、需要由人民法院调查收集证据的原因及其要证明的事实。若公司银行贷款资料符合上述条件，当事人可按此程序申请法院调查。

3. 银行保密义务与司法协助的平衡
   银行对客户资料负有保密义务，但根据《商业银行法》第三十条，商业银行依法向国务院银行业监督管理机构、中国人民银行报送统计数据、报表等资料以及按照有关规定向司法机关、行政机关提供有关资料，不受法律限制。因此，在司法程序中，银行有义务配合法院调查，提供与公司贷款相关的资料。

实务建议：

• 申请时需明确资料的具体内容（如贷款合同、还款记录、担保协议等）及与案件的关联性；
  
• 若银行以保密为由拒绝提供，可要求法院出具协助调查函或裁定书，强制银行配合；
  
• 注意申请时效，避免因逾期举证导致证据失效。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件中的证据申请策略。