结论：孕期公司搬迁且距离较远时，您确实有权选择在职仲裁，但具体是否适合在职仲裁需结合实际情况判断。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律背景与依据
《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。公司搬迁导致工作地点变更，属于劳动合同内容的变更，应与您协商一致。
- 若公司未与您协商一致就单方面变更工作地点，您有权拒绝，并可以依据《劳动合同法》第三十八条的规定，以公司未按照劳动合同约定提供劳动条件为由，提出解除劳动合同并要求经济补偿。
孕期女职工的特殊保护：
- 根据《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，孕期女职工享有特殊的劳动保护，包括不得安排其从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的劳动，以及在劳动时间内进行产前检查等。
- 若公司搬迁导致您上下班距离过远，可能对您和胎儿的健康造成不利影响，这也可以作为您与公司协商或提出仲裁的依据。
二、在职仲裁的适用性分析
在职仲裁的可行性：
- 在职仲裁是指劳动者在劳动关系存续期间，就劳动争议向劳动仲裁机构申请仲裁。在您的情况下，若公司搬迁导致您无法继续履行原劳动合同，且双方无法就变更劳动合同达成一致，您有权选择在职仲裁。
在职仲裁的考虑因素：
- 身体状况：孕期女职工的身体状况需要特别关注。若搬迁导致您上下班距离过远，可能增加您的身体负担，影响胎儿健康。在决定是否在职仲裁前，建议您先评估自己的身体状况。
- 工作稳定性：在职仲裁可能对您的工作稳定性产生一定影响。若仲裁结果不利于您，公司可能选择解除劳动合同。因此，在决定在职仲裁前，您需要权衡工作稳定性和个人权益。
- 仲裁结果预期：在决定在职仲裁前，建议您先咨询专业律师，了解仲裁结果的可能性和预期。若仲裁结果对您有利，且您希望继续在公司工作，可以与公司协商变更劳动合同或寻求其他解决方案。
三、法律建议与行动指南
与公司协商：
- 在决定在职仲裁前，建议您先与公司进行协商，表达您的关切和诉求。尝试就工作地点变更、工作时间调整或提供交通补贴等问题达成一致。
收集证据：
- 若协商无果，您需要开始收集相关证据，包括公司搬迁的通知、原劳动合同、工资单、产检记录等。这些证据将有助于您在仲裁过程中证明自己的权益受到侵害。
申请仲裁：
- 若您决定在职仲裁，应向当地劳动仲裁机构提交仲裁申请，并附上相关证据。仲裁机构将依法受理并审理您的案件。
寻求法律援助：
- 在整个过程中，若您感到困惑或无助，可以寻求专业律师的法律援助。律师将为您提供法律咨询、代理仲裁等服务，帮助您维护自己的合法权益。
最后，孕期公司搬迁且距离较远时，您确实有权选择在职仲裁。但具体是否适合在职仲裁需结合您的身体状况、工作稳定性和仲裁结果预期等因素进行综合考虑。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。