在行政诉讼中不能直接追究单位的刑事责任，而应通过刑事诉讼程序来处理。以下从多个角度为你详细分析：
一、行政诉讼与刑事诉讼的本质区别
- 行政诉讼：主要解决的是行政机关与公民、法人或其他组织之间的行政争议，其核心在于审查行政行为的合法性、合理性。比如，公民认为行政机关的行政处罚决定违法，就可以提起行政诉讼。
- 刑事诉讼：则是用于追究犯罪嫌疑人或单位的刑事责任，涉及犯罪行为的立案侦查、起诉、审判等程序。例如，单位涉嫌贪污受贿，就需要通过刑事诉讼来追究其刑事责任。
二、行政诉讼中发现单位犯罪的处理方式
移送司法机关：
- 在行政诉讼过程中，如果法院、原告或第三人发现单位存在犯罪行为，应当向有管辖权的司法机关（如公安机关、人民检察院）报案或举报。
- 法院在审理行政案件时，若发现单位涉嫌犯罪，也有责任将相关线索移送司法机关。移送时，法院需制作移送函，详细说明移送的理由、案件基本情况以及所移送的材料清单，并将相关证据材料一并移交。
司法机关的处理：
- 司法机关收到报案、举报或移送的案件后，会进行审查。若认为有犯罪事实且需要追究刑事责任，则立案侦查；否则，退回案件并书面通知相关单位或个人。
- 侦查终结后，案件会移送检察机关审查起诉。检察机关认为犯罪事实清楚、证据确实充分的，会提起公诉。法院则按照刑事诉讼程序审理单位犯罪案件，并根据事实和法律规定作出判决。
三、单位犯罪的常见类型及处罚
常见类型：
- 滥用职权类：如行政机关工作人员滥用职权，导致公共财产、国家和人民利益遭受重大损失，可能构成滥用职权罪。
- 贪污贿赂类：行政单位或其工作人员在行使职权过程中收受贿赂、贪污公款等，可能构成受贿罪、贪污罪等。
- 徇私舞弊类：如行政执法人员徇私舞弊，不移交应当追究刑事责任的案件，情节严重的，可能构成徇私舞弊不移交刑事案件罪。
处罚方式：
- 我国刑法对单位犯罪一般实行双罚制，即对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚（如有期徒刑、拘役等）。
- 在少数情况下，如私分国有资产罪，只处罚直接负责的主管人员和其他直接责任人员，而不处罚单位本身。
四、实际操作中的注意事项
证据收集与转化：
- 在行政诉讼中，当事人已收集和提交的一些证据可能对追究刑事责任具有重要价值，如行政机关作出行政行为的相关文件、记录等。这些证据在刑事诉讼中可能需要进行转化或补充。
- 根据犯罪构成要件，进一步收集财务账目、资金往来记录、相关人员证言等证据，以证明单位或其工作人员的犯罪行为。
配合司法机关调查：
- 当事人和相关人员应积极配合司法机关的调查工作，如实提供证据和信息。这有助于加快案件的审理进程，确保犯罪行为得到应有的惩罚。
法律程序遵循：
- 在整个过程中，必须严格遵循法律程序。无论是行政诉讼还是刑事诉讼，都有其特定的程序和规定。违反程序可能导致案件被撤销或重新审理。
总结来说，行政诉讼与刑事诉讼是两个独立的法律程序，各自有不同的适用范围和规定。在行政诉讼中发现单位犯罪行为时，应通过正当程序将线索移送司法机关处理，而不是在行政诉讼中直接追究刑事责任。如果你在行政诉讼或刑事诉讼中遇到任何问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。