在民事借贷关系中，一般不能直接申请法院调取对方的资金合法来源，但在特定条件下可依法申请法院调查取证。具体分析如下：

1. 常规情况下不能直接申请调取资金来源
   在民事借贷纠纷中，原告通常需承担举证责任，证明借贷关系成立（如借条、转账记录等）及对方未履行还款义务。资金合法来源属于被告的隐私或商业秘密范畴，法院不会主动介入调查，原告也无权直接申请调取。若原告仅以“怀疑资金非法”为由申请调查，法院通常会以“与案件无关”或“缺乏必要性”为由驳回。

2. 符合法定条件时可申请法院调查取证
   根据《民事诉讼法》第67条及《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，若原告能证明资金来源与案件“存在关联性”且“自身无法取得相关证据”，可申请法院调查。常见情形包括：

   • 被告抗辩资金非借贷所得：如被告主张转账系还款、投资款等，但未提供证据，原告可申请调取被告银行流水，证明资金实际用途；
     
   • 涉及非法集资、洗钱等违法线索：若原告有初步证据（如报警记录、监管部门通报）表明被告资金可能涉及犯罪，法院可能依职权或依申请调取证据；
     
   • 被告拒不提供关键证据：如被告持有资金来源证明（如合同、发票）但拒不提交，原告可申请法院责令其提供，或直接调取。

3. 申请调查取证的程序要求
   原告需在举证期限届满前提交书面申请，明确调查内容、证据线索及与案件的关联性。法院审查后，若认为申请“具有必要性”，会出具调查令或直接调取证据；若认为申请“滥用权利”或“无关案件”，会驳回申请。

建议：若您怀疑对方资金来源非法，可先收集初步证据（如转账记录、聊天记录中对方自认资金性质的陈述），再向法院申请调查。若缺乏证据，法院可能不予支持。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据规则为您分析可行性。