结论：擅自改变农用设施用地用途，确实不能办理食品生产许可，这主要基于土地管理法规以及食品生产许可相关法规的明确规定。以下从不同角度为您详细分析：

一、土地管理法规的限制

1. 农用设施用地用途的法定性：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，农用设施用地是专门用于农业生产的土地，其用途具有法定性，不得随意改变。这是为了保障农业生产的稳定性和可持续性，防止土地资源的滥用和浪费。

2. 擅自改变用途的法律后果：

   • 如果擅自改变农用设施用地的用途，如用于非农业建设或商业用途，将违反土地管理法规，面临行政处罚，包括责令限期改正、没收违法所得、罚款等。在严重情况下，还可能涉及刑事责任。

二、食品生产许可的相关法规

1. 食品生产许可的申请条件：

   • 根据《中华人民共和国食品安全法》及相关规定，申请食品生产许可需要满足一系列条件，包括生产场所的合法性、生产设备的符合性、生产人员的资质等。其中，生产场所的合法性是首要条件，即生产场所必须符合土地利用规划和用途管制要求。

2. 擅自改变用途对食品生产许可的影响：

   • 如果农用设施用地被擅自改变用途，用于食品生产，那么该生产场所将不符合土地利用规划和用途管制要求，从而无法满足食品生产许可的申请条件。因此，擅自改变农用设施用地用途的单位或个人，将无法获得食品生产许可。

三、实际案例与法律后果

• 在实际案例中，已有不少因擅自改变农用设施用地用途而无法办理食品生产许可的情况。这些单位或个人往往因为忽视了土地管理法规的严格性，而面临了严重的法律后果，包括无法开展食品生产活动、遭受经济损失等。

四、建议与合规途径

1. 严格遵守土地管理法规：

   • 单位或个人在使用农用设施用地时，应严格遵守土地管理法规，不得擅自改变其用途。如需改变用途，应依法办理相关手续，确保土地使用的合法性和合规性。

2. 咨询专业律师或相关部门：

   • 在涉及土地使用和食品生产许可的问题上，建议咨询专业律师或相关部门，以获取准确的法律意见和指导。这有助于避免因不了解法规而导致的违法风险和经济损失。

总结与启示：擅自改变农用设施用地用途不仅违反了土地管理法规，还无法满足食品生产许可的申请条件。因此，单位或个人在使用农用设施用地时，应严格遵守相关法规，确保土地使用的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。