房屋购置贷款合同结清后，一般不可以直接申请补税，但特定情形下可能涉及退税或补税问题，需结合具体情况分析。具体如下：

1. 正常结清贷款无补税情形
   房屋购置贷款合同结清本身不直接产生补税义务。个人所得税、契税等房屋交易相关税费的缴纳义务通常发生在交易环节（如购房时缴纳契税、出售时缴纳个人所得税或增值税），而非贷款结清阶段。若贷款结清时未发生房屋转让、继承等涉税行为，且原交易环节税费已依法足额缴纳，则无需补税。

2. 可能涉及退税或补税的特殊情形

   • 个人所得税专项附加扣除调整：若购房者在贷款期间享受了住房贷款利息专项附加扣除（如个人所得税法规定的每月1000元定额扣除），但结清贷款后未及时调整扣除信息，导致多扣税款，可在年度汇算清缴时申请退税。
     
   • 房屋转让涉税：若贷款结清后转让房屋，需按转让收入与原购房成本的差额缴纳个人所得税（满五唯一可免征）或增值税（满两年可免征）。若转让时发现原购房成本凭证缺失或计税依据错误，可能需补缴税款。
     
   • 契税补缴或退税：若购房时因面积误差、政策调整等原因导致契税计税依据变化，可在结清贷款后申请补缴或退税（如实际面积大于合同面积需补契税，反之可退税）。
     
   • 税务稽查补税：若税务机关在后续稽查中发现原交易环节存在少缴、漏缴税款（如隐瞒收入、虚增成本），即使贷款已结清，仍可能被追缴税款及滞纳金。

3. 操作建议

   • 核查原交易税费凭证：确认购房时契税、个人所得税等是否已足额缴纳，避免因历史问题被追缴。
     
   • 关注税收政策变化：如近期出台的契税优惠、个人所得税专项附加扣除调整等政策，可能影响退税或补税义务。
     
   • 咨询税务机关：若涉及房屋转让或专项附加扣除调整，建议提前向当地税务机关确认计税依据及流程，降低税务风险。

提示：税务问题具有较强专业性，建议结合具体交易环节、税费凭证及政策变化综合判断。如有疑问，可直接向我提供房屋交易时间、贷款结清时间、是否转让等关键信息，以便进一步分析。