企业扣发员工法定节假日工资是违法的，劳动者有权依法维护自己的合法权益。以下从多个角度为你详细分析：

法定节假日工资支付规定

根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条的明确规定，劳动者在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。这意味着，法定节假日是带薪休假，即使劳动者在法定节假日没有实际工作，用人单位也应当支付其正常的工资报酬。此规定旨在保障劳动者的休息权益，确保其在法定节假日期间能够得到应有的经济保障。

法定节假日加班工资的计算

若用人单位在法定节假日安排劳动者工作，根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，应支付不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%作为加班工资。具体计算公式为：

• 月工资基数÷21.75天×300%×加班天数

这里，21.75天是通常的月计薪天数。例如，员工正常月工资为5000元，若在法定节假日被安排加班1天，则应支付的加班费为：5000元÷21.75天×300%×1天≈689.66元。

实际案例说明

以员工正常月工资5000元为例，若当月包含元旦、春节等法定节假日，且员工按规定休假，则用人单位应全额支付这5000元工资，不得扣除法定节假日对应的工资部分。若员工在这些节假日被安排加班，则应按上述公式计算并支付加班费。

劳动者的权益保护

如果用人单位违反规定，扣发劳动者法定节假日的工资或未按规定支付加班费，劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：首先尝试与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，明确指出其扣工资行为违反法律规定，要求其补发被扣工资。这是解决纠纷的一种温和且直接的方式。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门举报投诉。劳动监察部门作为政府的监管机构，有权对用人单位的工资支付情况进行监督检查，并责令用人单位改正违法行为。这一途径能够为劳动者提供有效的行政保护。
3. 申请劳动仲裁：如果劳动监察部门的处理未能满足劳动者的诉求，或者劳动者希望直接通过法律途径解决纠纷，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁程序是一种高效、专业的纠纷解决机制，能够确保劳动者的合法权益得到公正的处理。
4. 提起诉讼：如果对仲裁结果不满意，劳动者还可以向人民法院提起诉讼。诉讼程序将为劳动者提供最终的司法救济途径，确保其权益得到充分的保护。

在维权过程中，劳动者应当注意保留好相关证据，如劳动合同、工资条、加班记录等。这些证据将在协商、投诉、仲裁或诉讼过程中发挥关键作用，帮助劳动者证明自己的权益受到了侵害。

综上所述，企业扣发员工法定节假日工资是违法的行为，劳动者有权依法采取多种措施来维护自己的合法权益。如果你遇到了类似的问题，或者有其他劳动纠纷方面的疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。