诊所未经许可擅自验配角膜塑形镜的，卫生监督部门将依据《医疗器械监督管理条例》和《医疗纠纷预防和处理条例》进行处罚，具体处罚措施需结合违法情节严重程度判定。以下从不同违法情形展开说明：

1. 未取得《医疗器械经营许可证》擅自验配
   角膜塑形镜属于第三类医疗器械，根据《医疗器械监督管理条例》第81条，若诊所未取得《医疗器械经营许可证》擅自开展验配业务，卫生监督部门将责令改正，没收违法所得及违法经营的医疗器械；货值金额不足1万元的，并处5万元以上15万元以下罚款；货值金额1万元以上的，并处货值金额15倍以上30倍以下罚款；情节严重的，责令停业，对违法单位的法定代表人、主要负责人等处上一年度收入30%以上3倍以下罚款，终身禁止其从事医疗器械生产经营活动。

2. 未建立并执行进货查验记录制度
   根据《医疗器械监督管理条例》第89条，若诊所未按规定建立并执行进货查验记录制度（如未查验供货者资质、医疗器械注册证等），卫生监督部门将责令改正，给予警告；拒不改正的，处1万元以上10万元以下罚款；情节严重的，责令停业，直至吊销《医疗机构执业许可证》。

3. 使用未注册的角膜塑形镜
   若诊所使用的角膜塑形镜未取得医疗器械注册证，根据《医疗器械监督管理条例》第81条，卫生监督部门将没收违法产品，并处货值金额15倍以上30倍以下罚款；情节严重的，责令停业，对相关责任人处上一年度收入30%以上3倍以下罚款。

4. 未按规定开展诊疗活动
   若诊所未按照《医疗纠纷预防和处理条例》要求，未在显著位置公示诊疗科目、人员资质等信息，或未按规定书写病历，卫生监督部门将依据该条例第47条，责令改正，给予警告，并处1万元以上5万元以下罚款；情节严重的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予或责令给予降低岗位等级或者撤职的处分，对有关医务人员可以责令暂停1个月以上6个月以下执业活动。

补充说明：

• 处罚需结合具体违法情节（如是否造成患者损害、是否多次违法等），若涉及刑事犯罪（如生产销售伪劣产品罪），还将移送司法机关追究刑事责任。
  
• 诊所若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
  

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