撤并义务教育农村学校时，其债权债务原则上由并入学校承接，若学校被撤销则由教育主管部门负责清理，具体处理方式需结合实际情况并遵循相关法律法规。 以下是详细分析：

1. 债权债务承接原则
   根据《中华人民共和国民法典》第六十七条，法人合并的，其权利和义务由合并后的法人享有和承担。因此，若农村学校被并入其他学校，原学校的债权债务应由并入学校承接。这一原则确保了债权债务的连续性，避免了因学校撤并导致的法律关系断裂。

2. 学校撤销时的处理方式
   若农村学校被撤销且无并入学校，根据《国务院办公厅关于规范农村义务教育学校布局调整的意见》，其债权债务应由教育主管部门负责清理。教育主管部门需组织专项审计，明确债权债务范围，并通过财政拨款、资产处置等方式妥善处理，确保不遗留历史问题。

3. 特殊情况处理

   • 资产处置与债务清偿：若学校撤并后仍有资产（如土地、校舍），可通过拍卖或划转方式变现，优先用于清偿债务。剩余资产按《事业单位国有资产管理暂行办法》规定上缴国库或划转其他教育机构。
     
   • 教职工权益保障：撤并过程中涉及的教职工工资、社保等债务，需按《劳动合同法》及教育系统相关政策优先处理，避免引发劳动纠纷。
     
   • 债权人协商机制：对于复杂债务，教育主管部门可牵头组织债权人会议，协商延期偿还、债务重组等方案，降低法律风险。

4. 程序合规性要求
   撤并决策需经县级人民政府批准，并报省级教育部门备案。处理债权债务时，需公开公示、接受监督，确保程序透明。若涉及重大债务纠纷，建议提前咨询法律专业人士，避免因程序瑕疵引发诉讼。

建议：若您具体遇到此类问题，可进一步提供撤并方案、债务清单等细节，我将结合地方政策为您分析风险点及应对策略。