结论：工资档缺失但有年终考核表，对工资认定和发放可能产生一定影响，但具体影响程度需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、工资档缺失的影响

1. 工资认定困难：

   • 工资档是确定员工工资水平的重要依据，它通常包含了员工的职位、级别、工龄、技能等因素对应的工资标准。如果工资档缺失，那么在确定员工具体工资时可能会遇到困难，需要依赖其他证据或公司规定来推断。

2. 可能引发争议：

   • 在没有明确工资档的情况下，员工和公司之间可能就工资水平产生争议。员工可能认为自己的工资应该更高，而公司则可能坚持按照某种标准或惯例来支付。这种争议如果无法通过协商解决，可能需要通过法律途径来裁决。

二、年终考核表的作用

1. 作为工资调整的依据：

   • 年终考核表通常是对员工一年工作表现的总结和评价，它可能包含员工的业绩、能力、态度等方面的信息。如果公司有根据年终考核结果调整工资的制度，那么年终考核表就可以作为调整工资的重要依据。

2. 辅助证明工资水平：

   • 在工资档缺失的情况下，年终考核表可以作为一种辅助证据来证明员工的工资水平。例如，如果年终考核表显示员工表现优秀，那么可以推断员工的工资可能相对较高；反之，如果表现不佳，则可能工资较低。但这种推断需要结合公司其他规定或惯例来综合判断。

三、综合分析与建议

1. 结合公司规定和惯例：

   • 在处理工资档缺失但有年终考核表的情况时，应首先查看公司的相关规定和惯例。如果公司有明确的工资调整制度或工资认定标准，那么应按照这些规定和标准来处理。

2. 协商与沟通：

   • 如果公司规定和惯例不明确或存在争议，建议员工与公司进行协商和沟通。通过协商，双方可以就工资水平达成一致意见，避免不必要的法律纠纷。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果协商无果，且员工认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律帮助。在这种情况下，年终考核表可以作为重要证据之一来支持员工的诉求。但需要注意的是，法律程序可能较为复杂和耗时，因此应谨慎选择。

进一步思考：为了避免类似情况的发生，公司应建立健全的工资管理制度和档案管理制度。明确工资档的制定、调整和保存流程，确保员工工资的透明度和公正性。同时，员工也应关注自己的工资档和年终考核表等文件，及时与公司沟通并确认相关信息，以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。