建设合同中约定甲方收到款项后付款，这样的条款本身并不违法，但其合法性和有效性需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细解释：
1. 合同自由原则的角度
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在平等、自愿的基础上，可以协商确定合同的内容，包括付款条件。因此，建设合同中约定甲方在收到特定款项后再向乙方付款，属于双方对付款条件的约定，只要该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是合法有效的。
2. 付款条件合理性的角度
虽然这样的条款在形式上合法，但其合理性需要结合实际情况来判断。如果甲方约定的“收到款项”是指从第三方（如业主或发包方）收到的与乙方工作成果直接相关的款项，且该条件在合同中明确约定，且双方对此均无异议，那么这样的条款是合理的。然而，如果甲方利用此条款故意拖延付款，或者该条件与乙方的工作成果无直接关联，导致乙方无法及时获得应得的报酬，那么这样的条款可能被视为不公平或不合理，乙方有权提出异议。
3. 合同履行风险的角度
从合同履行的风险角度来看，这样的条款可能给乙方带来一定的风险。如果甲方因各种原因（如第三方未付款、甲方资金问题等）无法或拒绝向乙方付款，乙方可能面临资金回笼困难、工期延误等风险。因此，乙方在签订合同时，应充分考虑这样的条款可能带来的风险，并采取相应的风险防范措施，如要求甲方提供担保、约定违约金等。
4. 法律后果的角度
如果甲方在收到款项后无正当理由拒绝向乙方付款，乙方有权依据合同约定和法律规定要求甲方承担违约责任。这可能包括要求甲方支付拖欠的款项、赔偿因违约造成的损失等。如果双方无法协商解决争议，乙方还可以通过诉讼或仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。
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