在事故责任五五分的情况下，伤者自己支付的部分医疗费用在某些特定条件下是可以通过合作医疗（医保）报销的，但具体情况需根据实际情形和当地医保政策来判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般原则
交通事故中的责任分担：
- 在机动车之间、机动车与非机动车或行人之间的交通事故中，通常存在第三方责任人。
- 医保基金遵循“不重复支付”原则，即应先由责任方按照责任比例承担相应赔偿。在第三方责任明确的前提下，医保基金一般不介入支付。
医保基金的支付范围：
- 医保基金主要用于支付参保人员因疾病或意外伤害（非第三方责任）产生的医疗费用。
- 交通事故中的医疗费用，原则上应由肇事方或其保险公司承担赔偿责任。
二、特殊情况下的医保报销
第三人应负担但不支付或无法确定第三人：
- 如果肇事方不支付其应承担的医疗费用，或者经过相关部门调查确实无法找到另一方责任人（如肇事车辆逃逸且始终未能侦破），伤者可以申请由基本医疗保险基金先行支付自己承担的那部分医疗费用。
- 医保基金支付后，有权向第三人追偿。
伤者自己承担全部责任或无第三方责任人：
- 如果伤者在交通事故中因自己的过错受伤，且没有第三方责任人，那么他因此产生的医疗费用是可以要求医疗保险报销的。
- 但需要注意的是，报销比例和流程可能因地区和医保政策的不同而有所差异。例如，有些地区可能要求伤者提供无第三方责任人的证明，或者对报销比例有所限制。
非严格意义上的交通事故：
- 如果虽然是事故，但并非严格意义上的交通事故（如在小区内自家车库倒车时受伤等），且该意外事故符合医保规定的意外伤害报销范围，同时排除了有第三方故意侵权等不能报销的情形，那么伤者自己支付的部分是可以按医保政策报销的。
三、实际操作建议
与肇事方协商：
- 伤者应首先尝试与肇事方协商解决医疗费用问题。如果协商成功，可以按照责任比例分担医疗费用，减少后续纠纷。
咨询社保部门：
- 若协商无果或肇事方无法支付，伤者应及时向当地社保部门咨询并申请医保先行支付。社保部门会根据当地医保政策和实际情况给出具体的指导和帮助。
保留证据：
- 无论何种情况，伤者都应保留好所有相关证据（如交通事故责任认定书、医疗费用发票等）。这些证据在日后可能的追偿或法律诉讼中至关重要。
总结来说，在事故责任五五分的情况下，伤者自己支付的部分医疗费用能否通过合作医疗报销，取决于多种因素，包括肇事方是否支付、能否确定第三方责任人、当地医保政策等。因此，建议伤者在处理此类问题时，务必咨询当地社保部门以获取准确的指导和帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。