小程序管理员、小程序负责人与主办单位法定代表人不一致时，是可以进行备案的，但需满足一定条件并履行相应手续。以下从不同角度进行详细分析：

1. 备案主体资格角度
   小程序备案的核心是确认主办单位（即小程序运营主体）的合法性，而非直接要求管理员或负责人与法定代表人一致。根据《非经营性互联网信息服务备案管理办法》及相关规定，备案需提交主办单位的营业执照、法定代表人身份证明等材料，以证明主体资格合法。只要主办单位是合法注册的法人或组织，且备案材料真实有效，即使管理员或负责人与法定代表人不一致，也不影响备案本身。

2. 备案信息填写角度
   在备案过程中，需填写“小程序负责人”信息，该负责人可以是主办单位授权的自然人（如员工、技术负责人等），但需提供主办单位出具的授权委托书及负责人身份证明。若管理员或负责人与法定代表人不同，需在备案系统中明确标注其身份（如“技术负责人”“运营负责人”等），并上传授权文件。部分平台（如微信小程序）可能要求负责人与备案主体有劳动关系（如签订劳动合同），此时需提供劳动合同或在职证明。

3. 法律责任承担角度
   法定代表人作为主办单位的法律代表，对小程序的合规运营承担最终责任。但若管理员或负责人因操作不当导致违法（如发布违规内容、侵犯知识产权等），主办单位仍需承担主体责任，而管理员或负责人可能因职务行为被追究内部责任（如公司纪律处分）或外部连带责任（如协助侵权）。因此，建议主办单位通过内部协议（如《小程序管理责任书》）明确管理员或负责人的权限与责任，降低法律风险。

4. 实际操作建议

   • 提前沟通：备案前与小程序平台（如微信、支付宝等）确认具体要求，部分平台可能对负责人身份有额外限制（如需为法定代表人或股东）。
     
   • 材料准备：确保备案材料完整，包括主办单位证件、法定代表人身份证明、负责人授权书及身份证明、劳动关系证明（如需）。
     
   • 动态更新：若管理员或负责人变更，需及时在备案系统中更新信息，避免因信息不一致导致备案失效或处罚。

总结：不一致情况不影响备案，但需通过授权文件、劳动关系证明等材料明确负责人身份，并确保主办单位对小程序运营承担主体责任。如有具体平台要求或复杂情形（如境外主体备案），可进一步向我咨询细节。