小程序企业主体备案流程中，主体负责人必须是法人，不能通过非法人进行备案。具体分析如下：

一. 主体负责人的要求

• 根据微信小程序备案的相关规定，对于非个人主体（如企业），小程序备案的主体负责人必须为法定代表人。这一要求确保了备案信息的真实性和准确性，同时也符合相关法律法规对于企业法人责任的规定。
• 例如，在河南地区，备案主体负责人必须是法定代表人，不支持授权给非法定代表人进行备案。

二. 小程序负责人的角色

• 小程序负责人与主体负责人是两个不同的角色。小程序负责人应为本单位/公司具体负责小程序管理、小程序维护的相关人员，这个人可以不是法定代表人。
• 但是，这并不意味着备案流程可以绕过法定代表人。主体负责人的备案信息仍然是必须的，且必须为法定代表人。

三. 备案流程中的其他要求

• 除了主体负责人必须是法定代表人外，备案流程还可能涉及其他材料和信息的提交，如营业执照、域名信息等。
• 这些材料和信息同样需要按照相关规定进行准备和提交，以确保备案的顺利进行。

综上所述，小程序企业主体备案流程中，必须通过法人作为主体负责人进行备案。这是微信小程序备案的明确规定，也是确保备案信息真实性和准确性的重要措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。