协商解除劳动合同的经济补偿金在一定条件下是需要交税的，具体分析如下：

一、经济补偿金的税务处理原则

根据《财政部、国家税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》（财税〔2018〕164号）的规定，个人与用人单位解除劳动关系取得一次性补偿收入（包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费），在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分按照《个人所得税法》的有关规定，计算征收个人所得税。

二、具体税务计算方式

1. 免税部分：经济补偿金在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，无需缴纳个人所得税。

2. 应税部分：超过当地上年职工平均工资3倍数额的部分，需要按照以下方式计算并缴纳个人所得税：

   • 计算应纳税所得额：应纳税所得额 = 经济补偿金 - 当地上年职工平均工资×3 - 速算扣除数（如有）
   • 确定适用税率：根据应纳税所得额，查找对应的个人所得税税率表，确定适用税率和速算扣除数。
   • 计算应纳税额：应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数

三、举例说明

假设某地区上年职工平均工资为10万元，员工A因协商解除劳动合同获得经济补偿金40万元。那么：

1. 免税部分：10万元×3 = 30万元，这部分无需缴纳个人所得税。

2. 应税部分：40万元 - 30万元 = 10万元，这部分需要缴纳个人所得税。

   • 假设这10万元对应的适用税率为10%，速算扣除数为2520元（具体数值需根据最新税率表确定）。
   • 则应纳税额 = 10万元 × 10% - 2520元 = 7480元。

四、特殊情况说明

1. 一次性补偿收入：如果经济补偿金是作为一次性补偿收入发放的，且符合上述免税条件，则无需缴纳个人所得税。但需要注意的是，如果一次性补偿收入中包含了其他非经济补偿性质的收入（如奖金、津贴等），则这些部分可能需要单独计算并缴纳个人所得税。

2. 多次发放：如果经济补偿金是分多次发放的，每次发放时都需要根据上述原则进行税务处理。即每次发放时都需要判断是否超过当地上年职工平均工资的3倍数额，并据此计算应纳税额。

五、建议与注意事项

1. 了解当地政策：由于不同地区的职工平均工资水平不同，因此免税额度也会有所差异。在计算经济补偿金的个人所得税时，需要先了解当地的职工平均工资水平。

2. 保留相关凭证：在协商解除劳动合同时，建议员工保留好相关的解除劳动合同协议、经济补偿金支付凭证等文件，以便在需要时进行税务申报和证明。

3. 咨询专业人士：由于税务处理涉及多个因素和复杂计算，如果员工对税务处理有疑问或不确定如何操作，建议咨询专业的税务人士或律师进行指导和帮助。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。