结论：骑小电驴（电瓶车）闯红灯是否会被扣小车驾驶证的分，主要取决于所骑小电驴的类型。如果小电驴被认定为非机动车，则不会扣驾驶证分；如果被认定为机动车（如电动摩托车等），则会依法扣除驾驶证分数。
一、小电驴类型及相应法律后果
非机动车（如电动自行车）：
- 性质界定：电动自行车通常设计时速较低、整车质量较轻，被归类为非机动车。
- 闯红灯后果：根据《道路交通安全法》，非机动车闯红灯将处警告或者五元以上五十元以下罚款。若驾驶人拒绝接受罚款，可扣留其非机动车。此类情况下不涉及驾驶证扣分，因为非机动车无需驾驶证。
机动车（如电动摩托车、电动轻便摩托车）：
- 性质界定：电动摩托车和电动轻便摩托车设计时速较高、整车质量较重，且电动机功率等达到机动车标准，需按照机动车管理，并持相应驾驶证（如D、E、F证）驾驶。
- 闯红灯后果：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》及《中华人民共和国道路交通安全法》，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分，并处罚款（通常为200元）。
二、如何判断小电驴类型
- 小电驴是否属于机动车，主要依据其设计时速、整车质量、电动机功率等参数，并结合当地交通管理部门的规定来判断。
- 一般来说，非机动车无需上牌，而机动车则需按照机动车标准上牌并接受管理。因此，可以通过查看车辆是否上牌以及上牌类型来初步判断车辆性质。
三、法律建议与实际操作
- 严格遵守交通规则：无论小电驴类型如何，闯红灯都是严重的交通违法行为，会危及自身和他人的安全。因此，驾驶小电驴时应严格遵守交通规则，确保道路安全。
- 了解当地管理规定：由于各地对小电驴的管理规定可能有所不同，建议驾驶人及时了解并遵守当地交通管理部门的具体规定，避免因不了解规定而违法受罚。
- 注意车辆分类：购买小电驴时，应明确了解其是否属于机动车范畴，以便在行驶过程中做好相应的准备和遵守相应的法规。如果车辆被认定为机动车，务必确保自己持有相应的驾驶证。
四、特殊情况说明
- 如果驾驶人持有的是小车驾驶证（如C1证），而驾驶的是被认定为机动车的电动摩托车或电动轻便摩托车，那么闯红灯时不仅会被扣分，还可能因准驾车型不符而面临更严重的处罚。
综上所述，骑小电驴闯红灯的处罚与小电驴的类型密切相关。驾驶人应充分了解自己的车辆类型，并严格遵守交通规则，以确保道路安全和避免不必要的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。