电动摩托车闯红灯被交警抓到，如果驾驶者持有相应的机动车驾驶证，那么会扣驾驶证的分。具体分析如下：

首先，电动摩托车在性质上属于机动车，根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，机动车驾驶者必须遵守交通规则，包括不得闯红灯。

其次，如果驾驶电动摩托车的驾驶者持有相应的机动车驾驶证（如D照或C照等），那么当其闯红灯被交警抓到后，交警会根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，对驾驶者进行记分处罚。具体来说，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。

因此，电动摩托车闯红灯被交警抓到后，如果驾驶者持有机动车驾驶证，那么会扣驾驶证的分，一次记6分。如果驾驶者没有持有相应的机动车驾驶证，那么则可能面临其他类型的处罚，如罚款、暂扣车辆等，但这种情况不涉及扣驾驶证分的问题，因为驾驶者本身就没有驾驶证可扣。

请注意，遵守交通规则是每个驾驶者的义务和责任，为了自身和他人的安全，请务必遵守交通信号灯指示通行。如有任何疑问或需要进一步了解相关法律问题，请直接向我咨询。