结论：判决生效后还未申请强制执行，被告主动履行相关款项后原判决被撤销的，一般情况下不能再申请执行原判决，但存在特殊情形时可能仍可申请执行或采取其他法律措施。以下从不同角度进行分析：
一、原判决被撤销后的一般法律后果
原判决被撤销意味着该判决自始不具有法律效力，即该判决被视为从未存在过。在这种情况下，如果被告已经主动履行了相关款项，且该履行行为是基于对原判决的尊重和执行，那么一旦原判决被撤销，被告的履行行为在法律上可能被视为没有合法依据的支付。然而，从实务角度来看，被告已经履行完毕，且履行行为并未违反法律规定或损害他人利益，因此通常不会要求被告返还已履行的款项。同时，由于原判决已被撤销，原告也无法再依据该判决申请强制执行。
二、特殊情形下的法律处理
被告履行后反悔或存在其他纠纷：
- 如果被告在履行后反悔，认为履行行为并非其真实意思表示或存在其他纠纷（如履行金额有误、履行方式不当等），被告可以与原告协商解决或通过法律途径寻求救济。但这种情况下，被告的救济途径并非是通过申请执行原判决，而是通过提起新的诉讼或申请仲裁等方式解决纠纷。
原判决被撤销后发现新证据或新情况：
- 如果在原判决被撤销后，原告发现了新的证据或情况，足以证明原判决的正确性或被告仍应承担相应的法律责任，原告可以重新提起诉讼或申请再审。但需要注意的是，重新提起诉讼或申请再审需要符合法律规定的条件，并经过法院的审查和裁决。
被告未完全履行或履行存在瑕疵：
- 如果被告虽然主动履行了相关款项，但履行并不完全或存在瑕疵（如部分履行、迟延履行等），且原判决被撤销的原因并非与被告的履行行为直接相关，那么原告可能仍有权要求被告继续履行或承担违约责任。但这种情况下，原告的请求权基础并非是原判决，而是基于双方之间的法律关系（如合同关系）和法律规定。
三、法律建议
对于原告：
- 在原判决被撤销后，如果认为被告仍应承担相应的法律责任，应及时收集证据并重新提起诉讼或申请再审。
- 在与被告协商解决纠纷时，应明确双方的权利义务关系，并签订书面协议以避免后续纠纷。
对于被告：
- 在履行相关款项前，应仔细审查原判决的内容和执行情况，确保履行行为的合法性和有效性。
- 如果在履行后发现原判决被撤销或存在其他纠纷，应及时与原告协商解决或通过法律途径寻求救济。
进一步思考：在实际操作中，原判决被撤销后的情况可能更为复杂多变。因此，在处理此类案件时，应充分考虑各种因素并谨慎行事。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。