工程总承包商在合同关系中通常作为乙方存在，而非甲方。以下从多个角度详细解释这一结论：
一、合同角色定义与职责
甲方（发包方）：
- 定义：甲方是工程项目的发起者和投资方，通常是项目的业主或建设单位。他们具有工程发包主体资格和支付工程价款的能力。
- 职责：甲方的主要职责包括提出项目建设需求、提供必要的建设资金、组织相关审批手续，并对工程项目拥有最终的决策权和所有权。
工程总承包商（乙方）：
- 定义：工程总承包商是受甲方委托，按照合同约定对工程项目的勘察、设计、采购、施工、试运行（竣工验收）等实行全过程或若干阶段承包的企业。
- 职责：工程总承包商的主要职责是依据合同要求，全面或分阶段地完成工程项目的建设任务，确保工程质量、安全、进度和成本符合合同约定，并向甲方交付符合要求的工程项目。
二、法律地位与合同关系
- 法律无严格定义：在法律上，“甲方”和“乙方”的称谓并无严格定义或区分，其具体指代完全依赖于合同条款的约定。然而，在工程建设项目中，为明确各自权利与义务，通常将发起工程项目、提供资金并要求获得工程成果的一方称为发包方（甲方），而将具有专业施工能力、按发包方要求完成建设任务并获取报酬的一方称为承包方（乙方）。
- 合同关系：工程总承包商与甲方之间形成的是合同关系，双方通过签订承包合同来明确各自的权利和义务。无论采用何种称谓，只要合同条款明确，法律均会认可其效力。
三、实际案例与模式说明
实际案例：
- 以某商业综合体建设项目为例，开发商作为甲方，通过公开招标选定建筑公司作为乙方（工程总承包商）。建筑公司负责施工图纸深化、材料采购、现场施工等全流程工作，并定期向开发商汇报进度。项目竣工后，开发商组织专业机构进行验收，确认合格后按约定支付工程款。
工程总承包模式：
- 工程总承包通常包括设计—施工总承包（D-B）和设计—采购—施工总承包（EPC）等模式。在这些模式下，总承包商对项目多个环节负责，如设计、施工，甚至包括设备采购等。然而，无论采用哪种模式，总承包商都是作为乙方的角色，与甲方形成紧密的合作关系。
四、特殊场景辨析
- EPC总承包模式：在EPC总承包模式下，设计-采购-施工一体化承包中，总包方虽承担更广泛职责，但本质上仍属于乙方范畴，需对甲方负责。
- 联合体承包：当多个承包商组成联合体投标时，各成员对外共同承担乙方责任，内部则通过协议划分具体分工。但无论如何划分，联合体整体仍作为乙方与甲方形成合同关系。
五、建议与指导
为避免工程合同中的潜在纠纷，建议在合同签订前：
- 充分沟通：双方应就工程项目的具体需求、施工标准、付款方式等进行充分沟通。
- 详细约定：在合同中详细列明双方的权利、义务、违约责任等条款。
- 法律审查：如有必要，可寻求专业律师的法律审查，以确保合同的合法性和有效性。
综上所述，工程总承包商在合同关系中通常作为乙方存在，与甲方形成明确的合同关系。在实际操作中，双方应明确各自的权利和义务，并在合同中详细约定，以预防后续纠纷和风险。如有任何法律疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。