针对您提出的问题，即民事判决书几年后执行中发现认定有误，但已过了再审申请期6个月的情况，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《民事诉讼法》的相关规定，当事人申请再审通常需要在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。然而，也存在一些特殊情况，即当符合《民事诉讼法》第二百条第一项（有新的证据，足以推翻原判决、裁定的）、第三项（原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的）、第十二项（据以作出原判决、裁定的法律文书被撤销或者变更的）或第十三项（审判人员审理该案件时有贪污受贿，徇私舞弊，枉法裁判行为的）规定情形时，当事人可以自知道或者应当知道之日起六个月内提出再审申请。

若您的情况并不属于上述特殊情形，且已经超过了常规的再审申请期限，那么直接向法院申请再审可能会面临困难。但您仍有以下途径可以尝试：

1. 向法院院长或上级法院反映：

   • 您可以向作出原判决的法院院长反映情况，如果院长认为判决确有错误且需要再审，会提交审判委员会讨论决定。
   • 同时，您也可以向上级法院反映，上级法院对下级法院的判决有权提审或指令下级法院再审。

2. 向人民检察院申请检察建议或抗诉：

   • 根据《民事诉讼法》第二百零九条的规定，如果人民法院驳回了您的再审申请，或者逾期未对再审申请作出裁定，或者再审判决、裁定有明显错误，您可以向人民检察院申请检察建议或者抗诉。
   • 人民检察院会对您的申请进行审查，并在三个月内作出提出或者不予提出检察建议或者抗诉的决定。

3. 收集新证据：

   • 如果您在执行过程中发现了新的证据，且这些证据足以推翻原判决，那么即使已经超过了再审申请期限，您也可以尝试通过其他途径（如上述的向检察院申请抗诉）来寻求救济。

4. 考虑其他法律途径：

   • 如果上述途径均无法解决问题，您还可以咨询专业律师，探讨是否可以通过其他法律途径（如提起新的诉讼）来维护自己的合法权益。

最后，我需要强调的是，法律程序具有严格的时间限制和条件要求。因此，在采取任何行动之前，建议您先咨询专业律师或法律机构，以确保您的权益得到充分保障。同时，也请您保持耐心和理性，通过合法途径来解决问题。