医疗事故协议签订三年后反悔，一般情况下不能直接起诉要求重新处理原医疗事故纠纷，但存在特定情形时可能有机会。以下从不同角度为你详细分析：

诉讼时效角度

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。不过，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

在医疗事故纠纷中，如果签订协议时，你清楚知晓协议内容且不存在被欺诈、胁迫等情形，那么从协议签订之日起，若认为协议存在不公平、不合理等情况想反悔，原则上应在三年诉讼时效内主张权利。若超过三年，从诉讼时效角度看，你起诉要求重新处理原医疗事故纠纷可能会面临败诉风险，因为此时对方可能会以超过诉讼时效进行抗辩。

协议效力角度

1. 协议合法有效且无瑕疵：如果签订的医疗事故协议是双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危、显失公平等法定可撤销或无效的情形，那么该协议对双方具有法律约束力。即使三年后你反悔，也不能随意推翻协议，起诉要求重新处理原医疗事故纠纷，法院一般不会支持你的诉求。
2. 协议存在可撤销或无效情形：
   • 可撤销情形：若签订协议时，一方存在欺诈、胁迫等行为，使你在违背真实意思的情况下签订了协议，那么你有权在知道或应当知道撤销事由之日起一年内请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。例如，医疗机构故意隐瞒重要医疗信息，导致你误以为赔偿金额合理而签订协议，之后你发现了这一欺诈行为，在符合条件的情况下可以起诉撤销协议，重新主张权利。不过，这个一年的撤销权行使期限是从你知道或应当知道撤销事由之日起算，并非从协议签订之日起算，但要注意整体不能超过法律规定的最长保护期限。
   • 无效情形：如果协议违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，那么该协议自始无效。比如，协议中约定医疗机构不承担任何责任，而该医疗事故明显是医疗机构存在重大过错导致的，这种免除医疗机构法定责任的条款可能因违反法律规定而无效。在这种情况下，你可以起诉确认协议无效，并重新就医疗事故纠纷进行处理。

证据收集角度

即使你认为存在可以反悔起诉的情形，随着时间的推移，证据收集可能会面临困难。病历资料可能丢失或损坏，关键证人的记忆也可能逐渐模糊，这些因素都可能对案件的审理和最终判决产生不利影响。所以，如果你有反悔起诉的想法，要尽早行动，及时收集和保存相关证据。

如果你遇到医疗事故协议签订三年后想反悔起诉的情况，建议你先梳理协议签订过程、自身知晓相关情况的时间等信息，判断是否存在可撤销或无效的情形，并尽快收集相关证据。若你对此还有疑问，可以直接向我咨询，我会结合具体情况为你详细分析。