公司注销的主管部门主要是市场监督管理部门（原工商行政管理部门），同时根据注销流程的不同阶段和具体事项，还可能涉及税务、社保、银行等多个相关部门。以下是对这一问题的详细解答：

一、市场监督管理部门

1. 职责：市场监督管理部门是公司注销的核心管理部门，负责接收并审核公司提交的注销申请及相关材料，如《公司注销登记申请书》、股东会决议或决定、清算报告等。审核通过后，市场监督管理部门会正式注销公司的营业执照，终止其法律主体资格。

2. 流程：公司需先成立清算组进行债权债务清理，并在市场监督管理部门备案清算组成员名单及负责人信息。随后，公司需在指定媒体上公告注销决定，通知债权人申报债权。公告期满后，公司可向市场监督管理部门提交注销申请及相关材料，等待审核。

二、税务部门

1. 职责：税务部门在公司注销过程中扮演着重要角色，负责核查公司是否完成税务申报、缴纳税款及滞纳金等。只有完成税务注销，取得《清税证明》后，公司才能继续推进工商注销程序。

2. 流程：公司需向主管税务机关提交税务注销申请，结清应纳税款、滞纳金及罚款，缴销发票和税务登记证件。税务机关审核通过后，会出具《清税证明》，作为公司税务注销的凭证。

三、社保部门

1. 职责：社保部门负责处理公司员工社保账户的转移或停缴事宜。在公司注销前，需结清欠缴的社保费用，并完成社保账户的注销。

2. 流程：公司需向社会保险经办机构提交社保注销申请，提供员工社保缴纳情况等相关材料。社保经办机构审核通过后，会注销公司社保账户，并出具相关证明。

四、开户银行

1. 职责：开户银行负责公司银行账户的注销工作。在公司注销前，需结清账户余额，并交回开户许可证等凭证。

2. 流程：公司需向开户银行提交银行账户注销申请，提供注销证明等相关材料。银行审核通过后，会注销公司银行账户，并办理相关手续。

五、其他相关部门

1. 特殊经营许可证注销：如果公司持有特殊经营许可证（如食品经营许可证），还需向原发证机关提交注销申请，完成相关注销手续。

2. 海关、外汇等部门：涉及进出口业务或外汇管理的公司，还需向海关、外汇等部门提交注销申请，完成相关注销手续。

建议与提醒

由于公司注销涉及多个部门和复杂流程，建议公司在注销前先咨询当地的市场监督管理部门或相关机构，了解清楚具体的要求和流程。同时，公司应确保在注销前完成所有债权债务的清理工作，避免留下法律隐患。如果在注销过程中遇到任何问题或困难，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。