违法圈占厂区的处罚需根据具体违法情形、占用性质及造成的后果综合判定，主要涉及行政处罚与刑事处罚两类，具体如下：

1. 行政处罚：针对一般违法圈占行为
   若圈占行为未达到刑事犯罪标准，但违反《土地管理法》《城乡规划法》等法规，可能面临：

   • 责令退还土地：由自然资源部门或综合执法部门责令限期退还非法占用的土地；
     
   • 拆除或没收违法建筑：对圈占范围内新建的建筑物、构筑物，依法强制拆除或没收；
     
   • 罚款：根据占用土地性质（如耕地、建设用地等），按每平方米100元至1000元的标准处以罚款；
     
   • 恢复原状：要求责任人限期清理圈占设施，恢复土地原状。
     

2. 刑事处罚：针对情节严重的犯罪行为
   若圈占行为符合以下情形，可能构成犯罪，需承担刑事责任：

   • 非法占用农用地罪（《刑法》第342条）：
     占用基本农田5亩以上，或一般耕地10亩以上，造成耕地种植条件严重毁坏或严重污染的，处5年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；
     
   • 非法转让、倒卖土地使用权罪（《刑法》第228条）：
     以牟利为目的，非法转让、倒卖土地使用权，情节严重的（如违法所得50万元以上），处3年以下有期徒刑或拘役，并处或单处非法转让、倒卖土地使用权价额5%至20%的罚金；
     
   • 其他关联犯罪：
     若圈占过程中伴随暴力抗法、行贿等行为，可能同时构成妨害公务罪、行贿罪等，需数罪并罚。
     

补充说明：

• 处罚主体：行政处罚由自然资源、城管等部门执行，刑事处罚由公安机关立案侦查，法院审判；
  
• 责任主体：包括直接实施圈占的个人、单位，以及指使、授意他人圈占的决策者；
  
• 救济途径：若对处罚决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
  

建议：若涉及具体案件，需结合圈占土地性质、面积、用途、主观故意等细节进一步分析。如有疑问，可直接向我提供更多信息，我将为您详细解答。