修公路在承包期内占用土地的赔偿归属问题，需根据土地所有权性质、相关法律法规及政策规定，并综合考虑特殊情况来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、土地补偿费
集体所有土地：
- 归属：根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》，土地补偿费归农村集体经济组织所有。该组织会按照法定程序或内部规定进行分配，以保障村民的合法权益。
- 特殊情况：若农村集体经济组织通过民主议定程序决定分配部分土地补偿费给集体经济组织成员，符合条件的成员可获得相应份额。例如，若土地承包经营权人因土地被征收而失去主要生活来源，且符合农村集体经济组织分配土地补偿费的条件，则可获得相应份额。
国有土地：
- 归属：土地补偿费归国有土地使用权人所有，如企业等。若承包期内占用的土地为国有土地，且承包方为国有土地使用权人，则土地补偿费应归承包方所有。
二、安置补助费
- 归属原则：安置补助费专款专用，用于安置因征收造成的失地农民的生产生活。
- 由农村集体经济组织安置：支付给农村集体经济组织，由其管理和使用。例如，农村集体经济组织可以利用安置补助费为失地农民提供就业培训、创业扶持等。
- 由其他单位安置：支付给安置单位。若失地农民被安置到其他单位工作，则安置补助费应支付给该单位。
- 不需要统一安置：发放给被安置人员个人或征得其同意后用于支付保险费用。若失地农民选择自主择业或不需要统一安置，则安置补助费可以发放给个人或用于支付保险费用。
三、地上附着物及青苗补偿费
- 归属：根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》，地上附着物及青苗补偿费归其所有者所有，即农民个人或其他合法所有者。若承包期内占用的土地上有农民种植的农作物或建设的附着物，则地上附着物及青苗补偿费应归农民个人所有。
四、特殊情况处理
- 土地承包经营权流转：若土地承包经营权存在流转，赔偿款的归属可能根据流转合同的约定来确定。合同约定赔偿款归承包方的，则归承包方；约定归受让方的，则归受让方。例如，若承包方将土地承包经营权流转给受让方，并在流转合同中约定土地被征收时的赔偿款归受让方所有，则受让方有权获得相应赔偿款。
五、法律建议
- 严格依法依规：在处理修公路占用土地赔偿问题时，应严格遵循相关法律法规和政策规定，确保赔偿款的归属和分配合法合规。
- 保障权益：在分配过程中，应充分保障被征地者的合法权益，特别是农村集体经济组织成员和地上附着物及青苗的所有者。
- 公开透明：农村集体经济组织在分配土地补偿费时，应遵循公开、公平、公正的原则，确保分配过程的透明度和公正性。
- 灵活处理特殊情况：对于土地承包经营权流转等特殊情况，应根据流转合同的约定和实际情况灵活处理赔偿款的归属问题。
若您在修公路占用土地赔偿问题上遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。