医院不让职工停车是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
若医院有明确的停车管理制度，且该制度合法合理：
- 医院作为用人单位，有权根据自身的实际情况和管理需要，制定停车管理制度。这些制度可能包括停车位的分配、使用时间、使用条件等。
- 如果这些制度是经过合法程序制定的，比如经过职工代表大会或全体职工讨论通过，并且内容合理，不违反法律法规的强制性规定，那么医院有权依据这些制度来管理职工的停车行为。
- 在这种情况下，如果医院不让某个或某些职工停车，且该决定是基于合法合理的停车管理制度作出的，那么这种行为通常是合法的。
若医院没有明确的停车管理制度，或者制度不合法不合理：
- 如果医院没有制定停车管理制度，或者制度内容违法（比如歧视性规定、违反公序良俗等），或者制定程序不合法（比如未经职工讨论通过），那么这些制度可能不具有法律效力。
- 在这种情况下，医院如果随意不让职工停车，可能构成对职工权益的侵犯。职工有权要求医院提供合理的停车条件，或者通过法律途径维护自己的权益。
特殊情况下的考虑：
- 如果医院因为特殊原因（比如施工、活动等）需要临时调整停车位的使用，且这种调整是合理且必要的，那么医院有权在合理范围内限制职工的停车行为。但这种情况下，医院应当提前通知职工，并说明调整的原因和期限。
- 另外，如果职工存在违反医院停车管理制度的行为（比如乱停乱放、占用他人车位等），医院有权依据制度对其进行处理，包括限制其停车。
法律建议：
- 对于职工而言，如果认为医院的停车管理制度不合法或不合理，或者医院的处理决定侵犯了自己的权益，可以先与医院进行沟通协商，寻求解决方案。
- 如果沟通无果，职工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的权益。
- 在处理此类纠纷时，职工应当保留好相关证据（比如医院的停车管理制度、处理决定、沟通记录等），以便在需要时提供证明。
可能后果：
- 如果医院的行为被认定为违法或侵犯职工权益，可能需要承担相应的法律责任，比如赔偿职工的损失、恢复职工的停车权益等。
- 对于职工而言，如果通过法律途径维护自己的权益并获胜，不仅可以获得相应的赔偿或恢复权益，还可以对医院形成一定的法律约束，促使其更加规范地管理停车行为。
总之，医院不让职工停车是否合法，需要根据具体情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。