顶楼种菜是否违法，主要取决于房屋产权归属、是否获得相关业主和物业的同意，以及是否符合相关法律法规和物业管理规定。以下是从不同角度的详细分析：
一、房屋产权归属的影响
公共区域禁止种菜：
- 如果顶楼属于全体业主共有（如未明确划分给特定业主的公共空间），则个人无权私自占用种菜。此类行为可能侵犯其他业主权益，违反《中华人民共和国民法典》中关于建筑物区分所有权的规定。根据《民法典》第二百七十一条，业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。因此，未经全体业主或业主大会同意，擅自改变顶楼用途种菜是违法的。
私有区域需合规使用：
- 若顶楼通过合法途径（如购房合同明确约定）归特定业主专有，种菜前仍需核查是否存在限制性条款。例如，部分开发商或物业公司可能在合同中约定不得改变顶楼用途，此时种菜可能构成违约。同时，即使顶楼属于个人产权，种菜过程中也不得损害公共利益或影响相邻关系。
二、相关业主和物业同意的重要性
- 经过全体业主和物业同意：
- 若种菜行为已经获得了全体相关业主的一致同意，并且也取得了物业管理部门的许可，同时在种植过程中没有对建筑物的安全、小区的公共秩序和环境卫生等造成不良影响，那么这种情况下在顶楼种菜是不违法的。但这种情况较为少见，因为通常需要获得全体业主的同意并不容易。
三、法律法规的底线要求
违反《物业管理条例》：
- 根据《物业管理条例》第四十九条，物业管理区域内的公共建筑和共用设施不得改变用途。顶楼作为共用设施，擅自用于种植违反了此规定。同时，《物业管理条例》第五十条也指出，业主和物业服务企业不得擅自占用物业管理区域内的场地，损害业主共同利益。顶楼种菜若未获全体业主同意，即构成对共同利益的侵害。
侵犯其他业主权益与安全隐患：
- 顶楼种菜若影响其他业主正常使用或生活（如异味、蚊虫等问题），则侵犯了他们的合法权益，可能引发相邻权纠纷。此外，种菜过程中的地面改造（如挖土、堆放重物）若操作不当，可能破坏顶楼防水层、承重结构等，对建筑物安全构成威胁。根据相关法律法规，业主应遵守规定使用建筑物，不得危及安全。否则，需承担相应责任。
四、违法行为的后果
- 对于违反规定在顶楼种菜的行为，物业管理公司或业主委员会有权制止并要求违规业主停止侵权行为、恢复原状。若违规业主拒不改正，物业管理公司或业主委员会可向相关部门投诉或提起诉讼以维护全体业主的合法权益。
五、建议与注意事项
- 在决定顶楼种菜前，务必了解并遵守当地的相关法律法规及小区管理规定。
- 若是共有区域，应事先征得全体业主或业主大会的同意，并制定详细的顶楼使用规则。
- 确保种植过程不会对建筑结构造成破坏，也不会对他人生活造成影响。
- 与邻居保持良好沟通，避免因种植行为引发不必要的矛盾。
综上所述，顶楼种菜的合法性取决于多个因素，包括产权归属、是否获得许可、是否遵守规定以及是否对他人或建筑安全造成影响。如果您确实有意在顶楼进行绿化或种植活动，建议先征得全体相关业主的同意并办理相关手续，以确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。