在公共楼顶上种菜是否违法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若公共楼顶属于全体业主共有，且未经全体业主同意种菜：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。公共楼顶作为建筑物的共有部分，其使用和管理需遵循全体业主的共同决定。
   • 法律后果：若未经全体业主同意，在公共楼顶上种菜可能构成对共有部分的擅自占用或改变用途，侵犯了其他业主的共有权。其他业主有权要求停止侵害、恢复原状，并可能要求赔偿损失。

2. 若公共楼顶的使用已通过业主大会或业主委员会的决定，明确允许种菜：

   • 法律背景：在业主大会或业主委员会的决定下，公共楼顶的使用方式可以被明确规定，包括是否允许种菜。若决定允许，则种菜行为在合法范围内。
   • 法律建议：即使决定允许种菜，也应确保种菜活动不违反相关法律法规，如不破坏楼顶结构、不影响排水系统、不造成安全隐患等。同时，应遵守物业管理规定，保持楼顶的整洁和卫生。

3. 若公共楼顶属于特定业主的专有部分（如顶层业主的露台），但种菜行为影响了其他业主的正常生活或公共利益：

   • 法律背景：即使公共楼顶（或露台）属于特定业主的专有部分，其使用也应受到一定限制，不得损害其他业主的合法权益或公共利益。
   • 法律后果：若种菜行为导致漏水、噪音、异味等问题，影响了其他业主的正常生活，或破坏了建筑物的整体美观和公共利益，其他业主有权要求停止侵害、排除妨碍，并可能要求赔偿损失。

额外建议：

• 在决定在公共楼顶上种菜前，建议先了解并遵守相关的物业管理规定和业主公约。
• 若对公共楼顶的使用存在争议，建议通过业主大会或业主委员会进行协商和解决。
• 若种菜行为可能涉及违法或侵权，建议及时咨询专业律师，以避免不必要的法律风险。

总结：公共楼顶上种菜是否违法，取决于楼顶的所有权归属、使用方式是否经过合法决定以及是否影响了其他业主的合法权益或公共利益。在决定种菜前，建议充分了解相关法律法规和物业管理规定，并遵守相关规定以避免法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。