异地司法机关来本地就危险作业罪进行取证，本地相关单位和个人应当配合，具体处理方式如下：

1. 司法机关协作层面：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，异地司法机关（如公安机关、检察院）有权在本地开展调查取证工作，但需通过法定程序进行。通常表现为：异地司法机关向本地同级司法机关（如本地公安局、检察院）提出协助请求，本地司法机关审核后予以配合。
   • 具体流程可能包括：异地公安机关向本地公安机关出具《调取证据通知书》《委托调查函》等法律文书，明确取证对象、范围及目的；本地公安机关核实文书真实性后，协助开展询问、勘验、检查、扣押等取证活动。

2. 被取证对象（个人/单位）层面：

   • 配合义务：若您或您所在单位被异地司法机关列为取证对象（如证人、涉案单位），需依法配合调查。拒绝配合可能构成《治安管理处罚法》第五十条规定的“阻碍执行职务”，面临警告、罚款或拘留处罚；情节严重的，可能触犯《刑法》第二百七十七条“妨害公务罪”。
   • 权利保障：您有权要求取证人员出示工作证件及法律文书（如《询问通知书》《搜查证》）；有权核对笔录内容，确认无误后签字；若取证行为违法（如超范围扣押、非法搜查），可向本地公安机关或检察院投诉，或通过行政复议、行政诉讼等途径维权。

3. 特殊情形处理：

   • 涉密或敏感信息：若取证涉及商业秘密、个人隐私或国家秘密，您可要求取证人员采取保密措施（如密封材料、限制知悉范围），并在笔录中注明。
   • 异地取证争议：若对异地司法机关的管辖权或取证程序有异议，可向本地司法机关提出书面意见，由两地司法机关协商解决；协商不成的，报共同上级机关指定管辖。

行动建议：

• 若您是证人或涉案单位，建议提前整理相关证据材料（如合同、监控录像、操作记录等），以便高效配合调查。
• 若您认为取证行为违法，可当场记录取证人员信息、时间地点及违规细节，后续通过法律途径维权。
• 如有疑问或需进一步协助，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您分析应对策略。