结论：确认建设工程合同无效本身不受诉讼时效限制，但因合同无效所引发的纠纷（如返还财产、赔偿损失等）则适用诉讼时效制度，一般为3年，自权利人知道或应当知道权利受到损害之日起算。以下是对此问题的详细分析：
一、合同无效的性质与特点
合同无效是法律对合同内容的否定性评价，它基于法律的强制性规定，旨在维护社会公共利益、交易安全和法律秩序。无效的合同自始没有法律约束力，即合同从成立时起就不具有法律效力，不能产生当事人预期的法律后果。因此，合同无效是自始无效、当然无效的法律状态，不应受诉讼时效的限制。
二、为何合同无效不受诉讼时效限制
- 自始无效性：合同无效系自始无效，单纯的时间经过不能改变无效合同的违法性。诉讼时效制度主要是为了督促权利人及时行使权利，避免权利义务关系长期处于不确定状态，而合同无效不存在因时间经过而使合同效力得到补正的问题。
- 立法目的：如果适用诉讼时效，可能使原本无效的合同因时间经过而变得有效，这与合同无效制度的立法目的相悖。合同无效制度的目的是为了维护法律的严肃性和社会的公共利益，而不是保护因违法行为而获得的利益。
三、因合同无效产生的纠纷与诉讼时效
虽然确认合同无效本身不受诉讼时效限制，但因合同无效所产生的纠纷（如请求返还财产、赔偿损失等）则适用诉讼时效制度。根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。这意味着，在合同无效后，如果一方要求另一方返还财产或赔偿损失，必须在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼或申请仲裁。
四、特殊情形下的诉讼时效问题
- 工程款支付纠纷：在建设工程合同无效的情况下，如果涉及工程款支付纠纷，诉讼时效的起算点可能因具体情况而有所不同。例如，如果工程已实际交付使用，但未办理验收手续，诉讼时效可能从实际交付使用之日起算。如果合同约定了明确的付款时间，则按约定时间起算。
- 质量争议处理：如果合同无效后存在质量问题需要修复，修复完成且验收合格后，诉讼时效可能重新起算。这是因为质量问题的修复可能改变了原有的权利义务关系，需要重新确定诉讼时效的起算点。
五、实务操作建议
- 及时主张权利：在合同无效后，如果涉及返还财产或赔偿损失等纠纷，应及时主张权利，避免超过诉讼时效期间。可以通过发函催款、提起诉讼或申请仲裁等方式来中断诉讼时效。
- 保留证据：在主张权利的过程中，应保留好相关证据，如合同、付款凭证、验收报告等，以证明自己的权利受到损害以及义务人的身份。
- 咨询专业律师：虽然我在这里提供了详细的法律分析，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在涉及具体案件时，建议直接向我咨询，以便根据案件的实际情况、相关法律法规以及当地法院的司法实践进行综合判断。
总结：确认建设工程合同无效本身不受诉讼时效限制，但由此产生的纠纷则适用诉讼时效制度。在实际操作中，应充分考虑法律法规和司法实践的具体要求，及时主张权利并保留好相关证据，以确保自身权益得到有效保护。