针对您提出的“虚开增值税专用发票抵顶进项补完税款后法院能否从轻处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，虚开增值税专用发票是一个严重的经济犯罪行为，其判决主要依据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释。根据这些法律规定，虚开增值税专用发票的处罚力度与虚开的税款数额以及造成的实际危害后果紧密相关。
一、基本法律规定与量刑标准
根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票的行为将受到严厉的处罚，包括有期徒刑、拘役以及罚金等。具体量刑会根据虚开的税款数额大小以及情节的严重程度来决定，数额越大、情节越严重，处罚也就越重。
二、补缴税款对量刑的影响
在您提到的情况下，如果行为人虚开增值税专用发票后，主动补缴了全部税款，这确实是一个重要的量刑考虑因素。法院在量刑时，会综合考虑犯罪的具体情节、虚开的税款数额以及造成的实际危害后果，同时也会关注行为人是否有悔罪表现，比如是否主动补缴税款、是否积极配合调查等。
三、从轻处理的条件
要获得法院的从轻处理，除了补缴税款外，还需要满足其他条件，如：
自首情节：如果行为人在犯罪后自动投案，并如实供述自己的罪行，这通常会被视为自首情节，法院在量刑时会予以充分考虑。
立功表现：如果行为人在犯罪后有立功表现，比如揭发他人犯罪行为、提供重要线索等，这也可能成为法院从轻处理的依据。
犯罪情节较轻：如果行为人的犯罪情节相对较轻，比如虚开的税款数额不大、没有造成严重的社会危害等，法院在量刑时也可能会予以从轻处理。
四、综合判断与建议
然而，是否能够从轻处理并不是单一因素决定的，而是需要法院根据案件的具体情况、行为人的悔罪表现以及社会危害程度等多方面因素进行综合判断。因此，即使行为人补缴了税款，也不能保证法院一定会从轻处理。
在实际案件中，我建议您尽快咨询专业律师以获取准确的法律建议和帮助。专业律师能够根据具体案情，为当事人提供有针对性的法律分析和辩护策略，以期达到最佳的法律效果。同时，您也应该积极配合调查，如实供述自己的罪行，并表现出真诚的悔罪态度，这有助于争取法院的从轻处理。