结论前置：有打卡记录但不上班是否算旷工，不能一概而论，而是需要依据公司的具体规章制度、员工未上班的具体原因以及相关法律法规进行综合判断。
一、公司规章制度的关键作用
明确规定：
- 如果公司规章制度中明确规定，仅打卡而未实际到岗工作视为旷工，并且该制度已经通过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等），且已向员工公示或员工已知晓并同意遵守，那么在这种情况下，员工有打卡记录但未上班，公司可以依据规章制度将其视为旷工。
制度合理性：
- 规章制度中的规定应当合理，不能过于严苛或不合理。例如，如果制度规定只要未打卡就一律按旷工处理，而不考虑客观因素（如打卡机故障、紧急公务等），则可能因缺乏合理性而不被法律认可。
二、员工未上班的具体原因
无正当理由：
- 如果员工有打卡记录但未上班，且无法提供合理的解释或证据（如突发疾病、家庭紧急情况等），那么公司可以依据规章制度将其视为旷工。
有合理理由：
- 如果员工有打卡记录但未上班，且有合理的理由（如因工作需要外出、打卡机故障导致无法打卡但已实际到岗等），并能提供相关证据，那么公司不应简单地将其视为旷工。在这种情况下，公司应与员工进行沟通，了解具体情况，并根据实际情况进行处理。
三、法律层面的考量
举证责任：
- 在劳动争议中，公司主张员工旷工需要提供充分的证据，如监控录像、门禁记录、同事证言等。单纯依赖打卡记录可能不足以直接认定员工旷工，因为打卡记录只能证明员工进行了打卡行为，而不能直接证明员工是否实际到岗工作。
合理性审查：
- 法院在审理劳动争议案件时，会审查公司规章制度的合理性以及处罚幅度是否与过错程度相当。如果公司的规章制度过于严苛或不合理，法院可能不会支持公司依据该制度对员工进行的处罚。
四、建议与措施
对于员工：
- 如果因某些原因需要在打卡后暂时离开岗位或无法到岗工作，应提前与上级或相关人员进行沟通，并确保自己的工作不会受到影响。
- 保留好相关的证据和记录，如请假条、通讯记录、工作任务安排等，以备不时之需。
对于公司：
- 制定和完善相关的规章制度，明确员工的行为规范及旷工的认定标准和处理方式。规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知。
- 在处理员工旷工问题时，应遵循公平、公正的原则，并依据事实和法律进行判定。避免任意性和歧视性，确保处理结果公平公正。
- 加强与员工的沟通协商，了解员工的实际情况和需求，共同维护良好的劳动关系。
总结：有打卡记录但不上班是否算旷工，需要综合考虑公司规章制度、员工未上班的具体原因以及相关法律法规。作为员工或公司，都应了解并遵守相关法律法规和规章制度，以维护自身的合法权益和良好的劳动关系。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。