是否构成行贿，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：
合法合作与行贿的界限
合法合作情形：
- 如果与民营门诊部医生的合作是基于真实的技术研发需求，双方签订了合法有效的合作协议，明确约定了研发内容、费用支付方式、知识产权归属等条款，且费用支付与研发成果、工作量等合理对应，那么这种合作及费用支付通常是合法的，不构成行贿。
- 例如，医生提供专业的医疗技术知识，你方提供资金、设备等支持，共同研发一款新的医疗产品，按照约定支付研发费用，这是正常的商业合作行为。
可能构成行贿的情形：
- 目的不正当：如果支付费用的目的是为了获取不正当利益，如通过医生的影响力或职务便利，使自己的产品能够违规进入门诊部使用、销售，或者获得其他不正当的竞争优势，那么这种行为可能构成行贿。
- 费用不合理：如果支付的费用明显高于市场合理水平，且无法合理解释其高额原因，可能被视为以费用为名行贿赂之实。比如，医生仅提供了少量的咨询服务，却收取了巨额的费用。
- 存在利益输送的暗示或约定：如果双方在合作过程中存在暗中的利益输送约定，如医生承诺在研发过程中给予特殊关照，或者你方承诺在产品成功后给予医生额外的回报等，这种行为也涉嫌行贿。
法律后果
- 如果构成行贿：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，行贿罪是指为谋取不正当利益，给予国家工作人员以财物的行为。虽然民营门诊部的医生不一定是国家工作人员，但如果其利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额较大的，可能构成非国家工作人员受贿罪。而给予财物的一方，则可能构成对非国家工作人员行贿罪。一旦定罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
- 如果不构成行贿：则双方的合作行为受法律保护，可以按照合作协议的约定继续履行义务、享受权利。
建议
- 审查合作协议：仔细审查与民营门诊部医生签订的合作协议，确保协议内容合法、合规，明确双方的权利和义务。
- 保留相关证据：保留与合作相关的所有证据，如合作协议、费用支付凭证、研发记录、沟通记录等，以便在需要时证明合作的合法性和合理性。
- 咨询专业意见：如果你对合作行为的合法性存在疑虑，或者已经面临相关的法律风险，建议及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
在商业合作中，务必遵守法律法规，确保合作行为的合法性和合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。