合作合同中违约赔付3倍违约金是否合法，需结合具体情况综合判断。以下是从不同角度的详细分析：

一、法律依据与合理性原则

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这一规定为合同双方约定违约金提供了法律基础。

2. 合理性要求：虽然法律允许双方约定违约金，但违约金的数额应当合理，不应过分高于或低于违约所造成的实际损失。这是为了维护交易的公平性和诚信原则。如果约定的违约金过分高于造成的损失，违约方有权请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。

二、具体判断标准

1. 一般合作合同：

   • 在一般的合作合同中，如果双方真实、自愿地约定了三倍违约金，且该约定不违反法律法规的强制性规定，也未显失公平，那么这种约定在法律上通常是有效的。
   • 然而，如果违约方认为约定的违约金过分高于造成的损失，可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。法院或仲裁机构会综合考虑实际损失、合同履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等因素，根据公平原则和诚实信用原则进行衡量，并作出裁决。

2. 特殊合作合同（如涉及金融、房地产等领域的合作合同）：

   • 在这些特殊领域的合作合同中，对于违约金的约定可能会受到更严格的限制。例如，金融监管政策或房地产调控政策等可能对过高的违约金进行规制，以维护市场秩序和公平交易。
   • 因此，在签订这些特殊领域的合作合同时，双方应特别注意违约金约定的合法性和合理性，避免因违反相关规定而导致合同无效或引发法律纠纷。

三、实际操作建议

1. 合同约定：在签订合作合同时，双方应充分协商并明确约定违约金的数额或计算方法。确保约定内容真实、合法、有效，并尽量做到具体、明确，以避免后续争议。

2. 争议解决：如果因违约金问题发生争议，违约方有权请求法院或仲裁机构进行适当调整。在申请调整时，应提供充分的证据来证明约定的违约金过高或过低，以便法院或仲裁机构能够作出公正、合理的裁决。

3. 法律风险防范：为了避免因违约金问题引发的法律风险，建议在签订合作合同时咨询专业律师（即我本人，安笑石律师，专注于合同纠纷领域），对合同条款进行审查和把关。确保合同条款的合法性和合理性，以维护双方的合法权益。

举例说明：假设甲乙双方签订了一份合作合同，约定如果一方违约，需向对方支付三倍违约金的赔偿。如果后来甲方违约给乙方造成了10万元的实际损失，而合同中约定的违约金为30万元。在这种情况下，乙方可以要求甲方支付30万元的违约金。但如果甲方认为这个违约金过高，可以请求法院或仲裁机构进行适当减少。法院或仲裁机构在综合考虑各种因素后，可能会将违约金调整为20万元或更低。

综上所述，合作合同中违约赔付3倍违约金是否合法，需要结合具体合同内容、实际损失情况以及法律的相关规定来综合判断。如果约定的违约金过高或过低，当事人都有权请求法院或仲裁机构进行适当调整。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。