结论：醉驾撞人后被对方打住院，能否起诉取决于具体情况。若对方行为构成故意伤害，你可以起诉要求赔偿；若对方行为属于正当防卫或防卫过当，则起诉可能面临一定法律障碍。以下是对此问题的详细分析：
一、对方行为构成故意伤害的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百三十四条，故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。
- 若对方在醉驾撞人后，出于报复或其他非防卫目的，对你实施殴打行为，且该行为导致你受伤，那么对方的行为可能构成故意伤害罪。
法律建议：
- 在此情况下，你可以向公安机关报案，要求追究对方的刑事责任。
- 同时，你可以提起民事诉讼，要求对方赔偿因殴打行为给你造成的医疗费、误工费、护理费等经济损失。
二、对方行为属于正当防卫或防卫过当的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二十条，为了使国家、公共利益、本人或者他人的人身、财产和其他权利免受正在进行的不法侵害，而采取的制止不法侵害的行为，对不法侵害人造成损害的，属于正当防卫，不负刑事责任。
- 正当防卫明显超过必要限度造成重大损害的，应当负刑事责任，但是应当减轻或者免除处罚。
- 若对方在醉驾撞人后，你继续对其实施攻击或威胁，对方为了保护自己的人身安全而采取防卫措施，且该措施在必要限度内，那么对方的行为可能构成正当防卫，不负刑事责任。
- 若对方防卫行为明显超过必要限度，造成你重伤或死亡等严重后果，那么对方的行为可能构成防卫过当，应当负刑事责任，但可以减轻或免除处罚。
法律建议：
- 在此情况下，你需要评估自己的行为是否构成对对方的不法侵害，以及对方的行为是否在必要限度内。
- 若你认为对方的行为不构成正当防卫或防卫过当，你可以向公安机关报案，并提起民事诉讼要求赔偿。但需注意，若对方行为被认定为正当防卫或防卫过当，你的起诉可能面临一定法律障碍。
- 若你认为自己的行为可能构成对对方的不法侵害，建议你在后续处理中保持谨慎，避免进一步激化矛盾。
三、其他注意事项
证据收集：
- 在处理此类案件时，证据的收集至关重要。你需要尽可能收集与案件相关的证据，如现场照片、视频、证人证言、医疗记录等，以支持你的主张。
法律程序：
- 无论是刑事报案还是民事诉讼，都需要遵循一定的法律程序。建议你咨询专业律师，了解具体的法律程序和要求，以确保你的权益得到充分保障。
和解与调解：
- 在处理此类案件时，和解与调解也是一种可能的解决方式。若双方能够达成和解或调解协议，可以节省时间和精力，避免进一步的法律纠纷。
最后，醉驾撞人后被对方打住院能否起诉，取决于对方行为的具体性质和法律后果。若你面临此类情况，建议你及时咨询专业律师，了解具体的法律建议和操作步骤。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。