在处理实际施工违反了中标文件和法律的情况下的竣工结算问题时，应首先明确的是，竣工结算的依据应当遵循合法、合规的原则，同时考虑实际施工情况与合同、法律之间的冲突及解决方式。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 中标文件与法律的优先性：

   • 中标文件：中标文件是招投标活动的结果，具有法律约束力，是合同的重要组成部分。它规定了工程的基本要求、价格、工期等关键条款。
   • 法律：法律是最高行为准则，任何合同条款或施工行为都不得违反法律规定。当实际施工违反法律时，该部分施工行为无效，且可能面临法律责任。
   • 优先性：在竣工结算时，若实际施工同时违反了中标文件和法律，应首先以法律为准绳，因为法律具有更高的效力。对于违反法律的部分，不应纳入竣工结算范围。

2. 实际施工情况与中标文件的差异处理：

   • 差异原因：实际施工可能与中标文件存在差异，原因可能包括设计变更、施工条件变化、材料供应问题等。
   • 处理原则：对于因合理原因导致的差异，且未违反法律的，应按照合同约定或双方协商的结果进行竣工结算。对于因施工方原因导致的差异，且违反中标文件或法律的，这部分费用不应计入竣工结算。

3. 竣工结算的具体操作：

   • 审核施工资料：首先，应审核施工过程中的各种资料，包括施工图纸、变更通知、验收记录等，以确定实际施工情况。
   • 对比中标文件：将实际施工情况与中标文件进行对比，找出差异点。
   • 法律审查：对差异点进行法律审查，判断其是否违反法律规定。
   • 确定结算范围：根据法律审查结果，确定哪些部分应纳入竣工结算范围，哪些部分应排除。
   • 编制结算报告：最后，根据确定的结算范围，编制竣工结算报告，并由双方确认。

4. 法律后果与风险防范：

   • 法律后果：若实际施工违反了法律，施工方可能面临行政处罚、民事赔偿等法律责任。同时，违反中标文件也可能导致合同违约责任。
   • 风险防范：为避免此类风险，施工方应在施工过程中严格遵守法律和中标文件的规定，及时与建设方沟通变更事宜，并保留好相关证据。

针对您的情况，我建议如下：

• 首先，对实际施工情况进行全面梳理，找出与中标文件和法律不符的部分。
• 其次，对不符部分进行法律审查，判断其性质及可能面临的法律后果。
• 然后，与建设方进行沟通，就竣工结算范围达成一致意见。
• 最后，编制并提交竣工结算报告，确保报告内容合法、合规、准确。

若您在处理此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和解决方案。