结论：在离婚纠纷中，即使与原告长期分居且未尽到妻子的义务，公积金仍可能被分割，但具体分割情况需根据公积金的性质、来源以及婚姻关系存续期间的具体情况来判断。
分析说明：
公积金的性质与来源：
- 公积金，特别是住房公积金，是职工及其单位共同缴纳的长期住房储金，用于职工购买、建造、翻建、大修自住住房等。其性质上属于夫妻共同财产的一部分，如果是在婚姻关系存续期间缴纳的。
婚姻关系存续期间的公积金：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，包括工资、奖金、劳务报酬，生产、经营、投资的收益，以及知识产权的收益等，原则上均属于夫妻共同财产。公积金作为职工工资的一部分（或视为工资的延伸），在婚姻关系存续期间缴纳的，同样应视为夫妻共同财产。
长期分居与未尽妻子义务的影响：
- 长期分居和未尽妻子义务，并不直接影响公积金作为夫妻共同财产的性质。这些因素可能在离婚时的财产分割、子女抚养、赡养费等方面作为考虑因素，但不影响公积金本身作为共同财产的认定。
- 然而，在具体分割时，法院可能会考虑双方的经济状况、贡献大小、婚姻期间的过错等因素，对公积金的分割比例进行适当调整。
公积金的分割方式：
- 公积金的分割通常需要通过协商或诉讼来实现。如果双方能够协商一致，可以签订协议明确公积金的分割方式和比例。
- 如果协商不成，则需要向法院提起诉讼，由法院根据具体情况判决公积金的分割。在诉讼过程中，双方需要提供相关证据证明公积金的缴纳情况、婚姻关系存续期间的具体情况等。
特殊场景：
- 如果公积金是在婚前缴纳的，且没有婚后继续缴纳或混同的情况，那么这部分公积金可能被视为个人财产，不参与离婚时的财产分割。
- 如果公积金的缴纳存在特殊情况，如一方使用非法手段获取公积金、公积金被用于非法目的等，那么这部分公积金可能不会被视为夫妻共同财产，或者即使被视为共同财产，也可能在分割时受到限制或惩罚。
行动建议：
- 在离婚纠纷中，如果涉及公积金的分割问题，建议双方首先尝试协商解决。协商时，可以明确公积金的缴纳情况、婚姻关系存续期间的具体情况等，以便达成公平合理的分割协议。
- 如果协商不成，建议及时向法院提起诉讼，并准备好相关证据材料。在诉讼过程中，要如实陈述事实、提供证据，并积极配合法院的审理工作。
- 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。作为专注于婚姻家庭领域的律师，我可以为你提供专业的法律咨询和诉讼服务。