当您购买的农机具没有合格证且存在质量问题时，您完全有权通过法律途径来维护自己的合法权益。以下是一个详细且有条理的起诉流程指南，希望能帮助到您：
一、准备阶段
收集证据：
- 采购关系证明：请务必保留好购买农机具的合同、订单、送货单、收货单以及发票等文件，这些都能证明您与卖家之间的交易关系。
- 质量问题证据：如果可能，请获取由第三方专业机构出具的质量检验报告，这将是最有力的证据。同时，拍摄农机具质量问题的照片、视频，并保留好农机具的样本。另外，与卖家的沟通记录（如邮件、短信、微信聊天记录等）也是重要的证据。
- 法律依据：请了解并引用《中华人民共和国产品质量法》和《中华人民共和国消费者权益保护法》中的相关规定，这些法律将支持您要求卖家承担因产品质量问题造成的赔偿责任。
确定管辖法院：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》，合同纠纷通常由被告住所地或合同履行地的人民法院管辖。在您的情况下，农机具的接收地通常可以视为合同履行地。
- 如果购买合同中双方对管辖法院有明确且合法的约定，那么请按照约定执行。
二、起诉与受理
撰写起诉状：
- 在起诉状中，请准确填写您和卖家的基本信息，包括姓名、地址、联系方式等。
- 明确列出您的诉讼请求，如要求卖家更换合格的农机具、退还货款、赔偿损失（包括直接和间接损失）以及承担诉讼费等。
- 详细陈述购买过程、发现质量问题的时间、地点、表现形式，以及您与卖家之间的协商经过。说明卖家的行为违反了合同约定或相关法律法规。
提交起诉状与证据：
- 将起诉状副本（按被告人数+1准备）连同所有证据材料提交给有管辖权的法院立案庭。
- 缴纳案件受理费，并等待法院的审查。如果法院认为符合立案条件，将会受理并出具立案通知书；如果不符合，法院会告知原因，您可以补充修改后再次起诉。
三、庭审与判决
送达与答辩：
- 法院会将起诉状副本等法律文书送达给卖家，卖家需要在规定时间内提交答辩状进行回应。
证据交换与质证：
- 双方会进行证据交换，并对对方的证据发表质证意见。请确保您提供的证据真实、关联且合法。
开庭审理：
- 在法庭调查阶段，双方会陈述案件事实，回答法官提问，并对证据进行说明。
- 在法庭辩论阶段，双方会围绕争议焦点进行辩论，阐述各自的观点和理由。
- 法院可能会组织双方进行调解，如果达成调解协议，法院会制作调解书，具有法律效力。
判决：
- 如果无法调解，法院会根据审理查明的事实和相关法律法规作出判决，明确双方的权利义务。
四、上诉与执行
上诉：
- 如果您对一审判决不服，可以在判决书送达之日起15日内向上一级法院提起上诉，提交上诉状并缴纳上诉费用。
执行：
- 如果判决书生效后，卖家未履行义务，您可以向法院申请强制执行，确保判决得到履行。
五、注意事项
- 请确保所有提供的证据真实、合法、有效，这是赢得诉讼的关键。
- 如果您需要委托律师进行诉讼，请提交授权明确的授权委托书及律师证复印件等相关文件。
- 请注意诉讼时效问题，避免超过诉讼时效而丧失胜诉权。
希望这个起诉流程指南能对您有所帮助。在维护自己合法权益的过程中，请保持冷静和理性，按照法律程序进行操作。祝您诉讼顺利！