当您发现自己的承包林地被占用时，这确实是一个需要严肃对待的问题。为了维护您的合法权益，您可以按照以下步骤来处理：
一、首先确认占用的性质
核实占用是否合法：
- 要求占用方出示其占地的合法审批文件，比如建设项目的立项批复、农用地转用审批手续等。这是判断占用行为是否合法的关键依据。
- 同时，您需要确认占用林地的用途是否符合法律规定和相关规划，避免林地被非法改变用途。
尝试与占用方协商：
- 在确认占用行为可能存在问题后，您可以主动与占用方进行沟通，了解其占用的原因和计划。
- 在协商过程中，您可以提出合理的诉求，比如要求占用方停止非法占用、恢复林地原状，并赔偿因此给您造成的损失。
二、请求政府部门介入处理
向林业部门反映情况：
- 如果协商无果，您应及时向当地的林业主管部门报告情况，并提供详细的证据，如承包合同、林地的现状照片等。
- 林业部门有权对非法占用林地的行为进行查处，并责令占用方停止违法行为，恢复林地原状。
涉及土地征收的处理：
- 如果占用行为是政府合法征收，但您对补偿有异议，您可以向自然资源部门或土地征收管理部门反映情况，要求他们按照法定程序进行处理。
三、通过法律途径维权
申请行政复议：
- 如果您对政府部门的处理结果不满意，您可以在规定的期限内向上一级行政机关申请行政复议，审查原行政行为的合法性和合理性。
提起民事诉讼：
- 您还可以以占用方侵犯您的林地承包经营权为由，向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求占用方承担民事责任，包括停止侵害、排除妨碍、恢复原状以及赔偿损失等。
提起行政诉讼：
- 如果您认为政府部门存在违法行政行为，您也可以提起行政诉讼，请求法院确认行政行为违法，并要求政府部门采取补救措施或进行赔偿。
仲裁机构调解：
- 如果您不愿意直接诉讼，您还可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，仲裁结果同样具有法律效力。
四、务必收集并保留好相关证据
- 在整个维权过程中，您务必妥善收集和保存相关证据，包括承包合同、林权证、现场照片、视频、证人证言以及政府部门的处理文件等。这些证据将对您维护自身权益起到至关重要的作用。
五、了解侵占行为的法律责任
- 如果侵占行为构成犯罪，比如非法占用林地数量较大且造成林地大量毁坏，侵占方将面临刑事处罚。此时，您可以向公安机关报案，追究其刑事责任。
综上所述，当您的承包林地被占用时，您应综合运用协商、行政处理、法律途径等多种手段来维护自身权益，并确保在整个过程中有足够的证据支持。同时，您也应了解侵占行为的性质，必要时寻求刑事法律的保护。希望这些建议能对您有所帮助。