建房子时父子三人签订的协议，核心在于明确各方权利义务、出资比例、产权归属及后续管理等内容，以下是一份协议框架及关键要点说明：

1. 协议主体信息
   需写明父子三人的姓名、身份证号、联系方式等基本信息，确保主体明确无误。若涉及未成年人，需注明法定代理人信息。

2. 建房目的与基本情况
   明确建房地址（需与土地权属证明一致）、土地性质（宅基地/集体建设用地等）、房屋规划用途（自住/出租等），避免因土地性质不符导致协议无效。

3. 出资方式与比例

   • 资金出资：若父子三人按比例出资，需写明各自出资金额及占总投资的比例（如父亲出资40%，长子30%，次子30%）。
     
   • 非资金出资：若有人以土地使用权、劳务、材料等方式出资，需明确折算价值及比例（如次子提供宅基地使用权，折算为30%出资）。
     
   • 出资时间：约定各方的出资期限（如协议签订后30日内付清），逾期需承担的违约责任（如每日0.5%的滞纳金）。

4. 产权归属与分配

   • 共有方式：明确房屋是按份共有（按出资比例）还是共同共有（不分份额）。
     
   • 份额分配：若按份共有，需写明各方所占份额（如父亲50%，长子25%，次子25%）；若共同共有，需约定未来分割条件（如婚姻变动、父母去世等）。
     
   • 产权登记：约定房屋登记在谁名下，或共同登记为共有人。若登记在一方名下，需注明其他方权益不受影响。

5. 建房管理与决策

   • 施工管理：约定由谁负责施工监督、质量验收、材料采购等具体事务。
     
   • 重大决策：明确需全体同意的事项（如变更设计、增加预算、对外借款等），避免单方决策引发纠纷。
     
   • 日常维护：约定房屋建成后的维修、保养责任及费用分担方式。

6. 收益分配与债务承担

   • 收益分配：若房屋用于出租或经营，需约定租金或利润的分配比例（如按出资比例分配）。
     
   • 债务承担：明确建房过程中产生的债务（如施工款、材料款）由谁承担，或按比例分担。

7. 协议变更与终止

   • 变更条件：约定协议变更需全体同意，或满足特定条件（如一方丧失行为能力）。
     
   • 终止条件：明确协议终止的情形（如房屋被征收、一方退出合作等），及终止后的财产清算方式。

8. 违约责任与争议解决

   • 违约责任：约定各方违反协议需承担的责任（如赔偿损失、支付违约金）。
     
   • 争议解决：优先选择协商解决，协商不成可约定仲裁或诉讼（如向房屋所在地法院起诉）。

示例条款（供参考）：

“第三条 产权归属

1. 房屋建成后，由父亲、长子、次子按份共有，父亲占50%份额，长子占25%份额，次子占25%份额。
   
2. 房屋登记在父亲名下，但长子、次子的共有权益不受影响，父亲不得擅自处分房屋。”

注意事项：

• 协议需由父子三人签字并按手印，最好有见证人（如亲属或村干部）签字。
  
• 若涉及宅基地使用权，需确保符合“一户一宅”政策，避免因违规建房导致协议无效。
  
• 协议签订后，建议到公证处公证或向当地房管部门备案，增强法律效力。
  

如有具体条款需要细化或调整，可直接向我咨询，我会根据您的实际情况提供进一步建议。