诽谤罪与扰乱国家机关工作秩序罪在一般情况下不会数罪并罚，但如果两个行为独立存在且均构成犯罪，或者存在特别情形，则可能会数罪并罚。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般情况下的处理原则
想象竞合犯的处理：
- 如果行为人出于一个犯罪故意，实施了一个犯罪行为，同时侵犯了两个犯罪客体，触犯了两个罪名，这种情况属于想象竞合犯。
- 对于想象竞合犯，我国刑法理论通常采取从一重罪处罚的原则，即按照行为所触犯的数个罪名中法定刑最重的罪名定罪处罚，而不实行数罪并罚。
- 在诽谤罪与扰乱国家机关工作秩序罪的情况下，如果行为人的诽谤行为同时扰乱了国家机关的工作秩序，且这两个行为之间存在紧密的关联性和不可分割性，那么可能构成想象竞合犯，从一重罪处罚。
牵连犯的处理：
- 牵连犯是指行为人实施某一犯罪，而其手段行为或者结果行为又触犯其他罪名的情况。
- 对于牵连犯，我国刑法理论通常也是按照从一重罪处罚的原则处理，除非刑法有特别规定。
- 在诽谤罪与扰乱国家机关工作秩序罪的情况下，如果行为人的诽谤行为是扰乱国家机关工作秩序的手段行为，且两者之间存在牵连关系，那么也可能按照从一重罪处罚的原则处理。
二、数罪并罚的特别情形
两个行为独立存在且均构成犯罪：
- 如果行为人的诽谤行为和扰乱国家机关工作秩序的行为是两个独立的行为，且这两个行为分别构成了诽谤罪和扰乱国家机关工作秩序罪，那么在这种情况下，应当对两个罪名分别定罪量刑，然后按照数罪并罚的原则处理。
存在特别规定或司法解释：
- 如果刑法或相关司法解释对诽谤罪与扰乱国家机关工作秩序罪的数罪并罚问题有特别规定，那么应当按照特别规定处理。
- 例如，如果某个司法解释明确规定，在某种特定情况下，诽谤罪与扰乱国家机关工作秩序罪应当数罪并罚，那么就应当遵循该司法解释的规定。
三、法律建议
- 对于行为人：应当明确自己的行为性质，避免同时触犯两个罪名。如果确实存在两个独立的行为，且均构成犯罪，那么应当做好接受数罪并罚的心理准备。
- 对于受害者：如果遭受了诽谤和扰乱国家机关工作秩序的双重侵害，应当及时向公安机关报案，并保留好相关证据，以便在后续的法律程序中维护自己的合法权益。
- 在具体案件中：是否数罪并罚还需要根据案件的具体情况、行为人的主观故意、行为方式、危害后果等因素进行综合判断。因此，在处理具体案件时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。