结论前置：跑客运时，若客运资格证持有者没有道路运输许可证，将面临责令停止经营、罚款乃至追究刑事责任的严厉处罚。具体处罚力度会依据违法所得情况、运输类型及地区法规差异而有所不同。
一、法律依据与处罚原则
根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路客运经营的，将受到以下处罚：
- 责令停止经营：县级以上地方人民政府交通运输主管部门会责令立即停止相关经营活动。
- 罚款：
- 若违法所得超过2万元，将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
- 若无违法所得或违法所得不足2万元，将处以1万元以上10万元以下的罚款。
- 刑事责任：若行为构成犯罪，如非法经营罪，将依法追究刑事责任。
二、具体处罚措施与运输类型
经营性道路旅客运输：
- 根据《道路运输从业人员管理规定》，未取得相应从业资格证件从事道路旅客运输活动的，将由县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令改正，并处200元以上2000元以下的罚款。但此规定主要针对从业资格证，若同时缺乏道路运输许可证，则处罚会更严厉，依据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条执行。
出租汽车客运：
- 对于从事巡游出租汽车、网约车服务的驾驶员，若未取得从业资格证或超越从业资格证核定范围驾驶出租汽车从事经营活动，将由县级以上出租汽车行政主管部门责令改正，并处1万元以上3万元以下的罚款。同样，若同时缺乏道路运输许可证，处罚将更为严厉。
三、地区差异与执行情况
- 地区差异：不同地区在具体执行处罚时可能存在差异，因为各地的法规和执行力度可能有所不同。例如，某些地区可能对首次违规者给予较轻的处罚，而对多次违规者则加重处罚。
- 执行情况：在实际执行中，执法部门会根据违法行为的严重程度、违法所得情况、是否造成危害后果等因素来综合判断处罚力度。因此，即使在同一地区，不同案件的处罚结果也可能存在差异。
四、实际建议
- 确保合法经营：从事客运活动的驾驶员和经营者务必确保取得相应的道路运输许可证和客运资格证，以避免法律风险和经济损失。
- 了解地区法规：由于地区差异的存在，建议驾驶员和经营者在从事客运活动前，先了解当地的具体法规和执行力度，以便更好地遵守法律并规避风险。
- 及时咨询与应对：若面临法律处罚或疑问，建议及时向我咨询，以便更准确地了解可能的法律后果和应对方式。
综上所述，跑客运时若客运资格证持有者没有道路运输许可证，将面临严厉的法律处罚。为了遵守法律法规并保障自身和他人的合法权益，请务必确保合法经营并了解当地法规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。