您好，关于付款是在初审还是二审结束后的问题，这主要取决于具体的项目类型和付款流程规定。以下是我根据不同情况为您详细解答：
一、对于一般建设项目（以铜陵市住建局为例）
在铜陵市住建局的建设项目资金支付流程中，付款并非直接在初审或二审（这里可能指的是类似“提请会议研究”的审定环节）结束后进行，而是经过一系列审核审批程序后，最终由局财务科依据经各分管领导签字确认的《建设项目计划付款汇总表》进行款项支付。具体流程包括：
- 提出付款申请：项目施工（监理）单位根据合同约定和项目进展情况提出书面申请。
- 申请初审：项目承建单位、局项目分管科室、局财务科分别就申请付款建设项目的工程进度、资金支出预算等进行初审。
- 资金计划汇总：初审合格后，报局城建科（项目办）汇总编制建设项目计划付款表。
- 提请会议研究：将汇总的建设项目付款计划提交局长办公会集体研究审定。
- 资金支付：局财务科依据审定后的《建设项目计划付款汇总表》进行款项支付。
二、对于政府投资项目（以沭阳县政府为例）
在沭阳县政府的政府投资项目工程款支付方式中，付款通常与工程进度和决算审计相关联，而非直接对应初审或二审环节。具体来说：
- 建安工程、交通市政工程等：这些工程在完工并经验收合格后，会安排决算审计。审计决算后，扣除质保金后按审计决算价付清余款。
- 绿化工程、亮化工程等：这些工程在初验、复验、终验合格后，会分阶段支付工程款，并在终验合格后安排决算审计，最终按审计决算价付清余款。
- 零星工程：工程完工经验收合格后，支付部分工程款，满一年整后按审计决算价付清余款。
总结：
- 在一般建设项目中，付款是在经过一系列审核审批程序，包括初审和可能的审定环节（如局长办公会研究）后，由财务部门依据审定后的付款计划进行支付。
- 在政府投资项目中，付款通常与工程进度和决算审计相关联，审计决算后才会支付余款。
因此，无法简单地回答付款是在初审还是二审结束后进行，而是需要根据具体的项目类型和付款流程规定来确定。如果您有具体的项目或合同细节，我可以为您提供更精确的解答。