核心结论：针对妻子与他人育有子女的情况，若需通过协议书明确双方权利义务，建议从财产分割协议或离婚协议两个方向拟定，具体需结合双方协商结果及法律要求。以下为详细说明：

一、协议类型选择

1. 财产分割协议（非离婚场景）
   若双方暂不离婚，但需对共同财产、债务等事项进行约定，可签订《夫妻财产约定协议》。需注意：

   • 内容合法性：协议不得违反法律强制性规定（如禁止剥夺一方基本生活保障）；
     
   • 忠诚条款效力：若协议中约定“因出轨导致离婚则净身出户”等条款，可能因违反公序良俗被认定无效；
     
   • 公证建议：为增强证明力，可对协议进行公证。

2. 离婚协议（拟离婚场景）
   若双方决定离婚，需签订《离婚协议书》，内容应包括：

   • 子女抚养：明确非婚生子女与婚生子女的抚养权、抚养费、探视权等；
     
   • 财产分割：列明共同财产范围（如房产、存款、投资等）及分割方式；
     
   • 债务承担：区分共同债务与个人债务，避免一方无故承担对方债务；
     
   • 补偿条款：若一方存在过错（如出轨），可约定精神损害赔偿，但需符合当地司法实践标准。

二、协议书关键条款

1. 身份信息：双方姓名、身份证号、联系方式等；
   
2. 事实陈述：简要说明婚姻状况及非婚生子女事实（避免主观评价，仅陈述客观事实）；
   
3. 权利义务：
   
   • 财产分割具体方案（如房产归哪方、存款如何分配）；
     
   • 非婚生子女抚养费支付标准及方式；
     
   • 探视权行使方式及限制条件；
     
4. 违约责任：明确一方未履行协议的后果（如支付违约金）；
   
5. 争议解决：约定纠纷解决方式（如诉讼或仲裁）。

三、法律风险提示

1. 非婚生子女权益：根据《民法典》第1071条，非婚生子女与婚生子女享有同等权利，协议不得损害其合法权益；
   
2. 协议效力：若协议内容显失公平或存在欺诈、胁迫情形，可能被撤销；
   
3. 公证与见证：建议由律师起草协议并见证，或通过公证增强效力，避免因条款歧义引发纠纷。

四、操作建议

1. 协商优先：双方应充分沟通，尽量达成一致意见；
   
2. 律师协助：协议涉及复杂财产分割或子女抚养问题时，建议委托律师起草或审核；
   
3. 登记备案：涉及房产、车辆等财产过户的，需及时办理变更登记。

若需进一步了解协议书具体条款或法律程序，可直接向我咨询，我会根据您的实际情况提供详细方案。