物流公司内部设立加油站是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
如果物流公司具备相关资质并获得许可：
- 根据《成品油市场管理办法》等相关规定，企业若要设立加油站，必须满足一系列条件，包括但不限于拥有稳定的成品油供应渠道、符合当地加油站行业发展规划、具备相应的安全、消防等条件，并经过相关部门的审批和许可。
- 如果物流公司已经获得了这些必要的资质和许可，那么在其内部设立加油站是合法的。这种情况下，加油站需要遵守国家关于成品油销售、安全、环保等方面的法律法规，确保合法经营。
如果物流公司未具备相关资质或未获得许可：
- 如果物流公司没有获得设立加油站的必要资质和许可，或者其设立加油站的行为违反了当地加油站行业发展规划、安全、消防等规定，那么这种行为就是违法的。
- 违法设立加油站可能面临多种法律后果，包括但不限于被责令停止经营、罚款、没收违法所得，甚至可能构成非法经营罪等刑事犯罪，面临刑事处罚。
额外法律建议：
- 对于物流公司而言，如果确实有设立内部加油站的需求，应当首先了解并遵守国家关于成品油销售、安全、环保等方面的法律法规，确保自身具备设立加油站的必要资质和条件。
- 同时，物流公司应当积极与当地相关部门沟通，了解加油站行业发展规划和审批流程，按照规定的程序申请设立加油站，确保合法经营。
- 如果物流公司已经违法设立了加油站，应当立即停止经营，并主动向相关部门报告情况，积极配合调查和处理，以减轻可能的法律后果。
可能涉及的法律后果举例：
- 如果物流公司违法设立加油站并被查处，可能会面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 如果违法设立加油站的行为情节严重，构成非法经营罪等刑事犯罪，物流公司及其相关责任人员可能会面临刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。
总结与提醒：
物流公司内部设立加油站是否违法，取决于其是否具备相关资质并获得许可。为了确保合法经营并避免法律风险，物流公司应当严格遵守国家法律法规和行业规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。